大姨妈时间长总不干净，可能由内分泌失调、子宫肌瘤、子宫内膜炎、子宫内膜息肉、全身性疾病等因素引起。
1. 内分泌失调：人体内分泌系统负责调节激素平衡，当内分泌失调时，雌激素和孕激素的分泌比例会出现异常。雌激素持续刺激子宫内膜，使其过度增生，无法按照正常周期完整脱落，就会导致经期延长、月经淋漓不尽。长期的精神压力、生活不规律、过度节食等都可能引发内分泌失调。
2. 子宫肌瘤：子宫肌瘤是女性生殖器官中常见的良性肿瘤。当肌瘤生长在子宫黏膜下或肌壁间时，会使子宫腔面积增大，子宫收缩受到影响。这会导致子宫内膜脱落过程不顺畅，血管闭合困难，从而引起月经时间延长、经量增多等症状。
3. 子宫内膜炎：细菌等病原体感染子宫内膜引发炎症。炎症会使子宫内膜充血、水肿，影响其正常的修复和剥脱过程。在月经期间，子宫内膜不能正常完整地脱落和修复，就会导致月经持续时间延长，还可能伴有腹痛、白带异常等症状。
4. 子宫内膜息肉：子宫内膜局部过度生长形成息肉。息肉会干扰子宫内膜的正常周期性变化，影响子宫的收缩和内膜的修复。在月经期间，息肉所在部位的内膜脱落和修复不同步，导致月经血持续流出，出现月经时间长不干净的情况。
5. 全身性疾病：如血小板减少性紫癜、再生障碍性贫血等血液系统疾病，会影响人体的凝血功能。在月经期间，由于凝血机制异常，子宫内膜脱落处的血管不能及时止血，从而导致月经时间延长、月经量增多。此外，甲状腺功能减退等内分泌疾病也可能影响月经周期和经期。
对于大姨妈时间长总不干净的情况，治疗方法需根据具体病因选择。如果是内分泌失调，可使用戊酸雌二醇、黄体酮、地屈孕酮等药物调节激素水平，但需遵医嘱使用。对于子宫肌瘤、子宫内膜息肉等情况，可能需要手术治疗。子宫内膜炎则需要使用抗生素，如头孢克肟、甲硝唑、阿奇霉素等进行抗感染治疗。全身性疾病引起的，需要积极治疗原发疾病。当出现大姨妈时间长总不干净的情况，建议及时到正规医院的妇产科就诊，进行详细检查，明确病因后进行针对性治疗。
大姨妈时间长总不干净会给女性带来诸多不便和困扰，其原因较为复杂。了解常见的病因，如内分泌失调、子宫肌瘤、子宫内膜炎、子宫内膜息肉和全身性疾病等，有助于及时发现问题并采取相应的治疗措施。一旦出现异常情况，应及时就医，以便明确病因，进行有效的治疗，保障女性的生殖健康。