月经不来肚子疼可能隐藏的大疾病有内分泌失调、多囊卵巢综合征、卵巢早衰、宫腔粘连、宫外孕等。
1. 内分泌失调：人体内分泌系统分泌各种激素，与神经系统共同调节人体的代谢和生理功能。当内分泌失调时，激素水平紊乱，会影响月经周期，导致月经不来。同时，激素失衡可能引起子宫平滑肌收缩异常，进而引发肚子疼。治疗方面，可使用乌鸡白凤丸、逍遥丸、加味逍遥丸等药物调节内分泌，但需遵医嘱。
2. 多囊卵巢综合征：这是一种常见的妇科内分泌疾病，主要表现为雄激素过高、持续无排卵、卵巢多囊样改变。患者的卵巢功能异常，卵泡发育障碍，无法正常排卵，从而导致月经稀发甚至闭经。由于卵巢的异常变化，可能会引起下腹部隐痛或坠胀感。治疗可选用达英 - 35、优思明、妈富隆等药物调节激素水平，具体用药需遵医嘱。
3. 卵巢早衰：指女性在 40 岁之前出现卵巢功能减退。卵巢功能衰退后，雌激素分泌减少，子宫内膜无法正常生长和脱落，就会出现月经不来的情况。同时，雌激素水平降低可能导致盆腔内组织和器官的功能改变，引起肚子疼。治疗时可使用戊酸雌二醇片、尼尔雌醇片、结合雌激素片等药物补充雌激素，需在医生指导下使用。
4. 宫腔粘连：通常是由于人工流产、刮宫等宫腔操作，导致子宫内膜基底层受损，子宫前后壁相互粘连。粘连会阻碍经血的排出，造成月经不来。而且，经血积聚在宫腔内，会引起子宫收缩，产生肚子疼的症状。治疗一般需要通过宫腔镜手术分离粘连，术后还可能需要使用抗生素预防感染，如头孢克肟、阿莫西林、甲硝唑等，具体用药遵医嘱。
5. 宫外孕：受精卵在子宫体腔以外着床称为异位妊娠，习称宫外孕。宫外孕时，受精卵在输卵管等部位生长，随着胚胎的发育，会导致输卵管膨胀、破裂，引起剧烈腹痛。同时，宫外孕会影响正常的月经周期，导致月经不来。一旦怀疑宫外孕，需立即就医，根据具体情况选择药物治疗（如甲氨蝶呤）或手术治疗。
月经不来肚子疼可能是多种大疾病的信号，不能掉以轻心。如果出现这种情况，应及时到正规医院就诊，进行相关检查，如性激素六项、B 超等，以明确病因，并在医生的指导下进行针对性治疗。早期诊断和治疗对于改善病情、预防并发症至关重要。