1、Ⅱ型单纯疱疹病毒极具伪装性，诱导机体防御功能失常。临床表明Ⅱ型单纯疱疹病毒变异后可进行自我伪装，让机体无法识别，或者释放假信号避免药物和免疫系统对它的杀灭作用，给治疗带来很大不变，即使治愈也可能是暂时性的一种假象，很容易再次多次发作。Ⅱ型单纯疱疹病毒特殊附着性，使得传统治疗很难攻克。

2、Ⅱ型单纯疱疹病毒（HSV）潜伏于神经节内。潜伏的Ⅱ型单纯疱疹病毒麻痹机体免疫调节机能，在机体各项免疫机能正常时时蛰伏待机，当机体调节机能紊乱，因炎症等免疫功能低下时，病毒迅速激活，危害组织器官，在治疗上药物很难从神经节内清理病毒，治疗同时对自身的损伤也较大。

3、生殖器疱疹发病多合并其它疾病，临床治疗中易被忽视。在临床实际治疗中，生殖器疱疹往往不是单独发病，一般都是在其它炎症或隐性感染后发病。而在实际治疗中大多被忽视，这样给多次发作和病毒转移提供了客观因素。同时由于治疗上的困境，治疗中由于药物的相左等情况，如同时对相应情况治疗，药物间将相互反应，对药效发挥将起到负面作用，利于病毒的繁殖，给传统治疗带来必须困难，是的传统治疗更加局限。

4、人体自身免疫力弱。一般生殖患者的自身免疫力较弱，在经综合治疗，少数残余的病毒发生变异，人隐藏于神经细胞内，当患者免疫力下降时，如生病、发热、酗酒、劳累时，潜伏的病毒重新复活，开始繁殖，然后大量复制出新病毒，又沿神经轴返回皮肤黏膜，引起新的疱疹，病灶逐渐扩大，从而出现疱疹多次发作。

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