卵巢巧克力囊肿是“肿块”但并非是“肿瘤”，它是子宫内膜异位症的一种病变。子宫内膜异位症的主要症状是痛经，它的痛经特点是渐进性痛经，是继发性和进行性加重。其次是不孕，和月经紊乱及性交痛等。

　　巧克力卵巢囊肿的原因目前尚不明确，专家推测可能主要与遗传及免疫因素有关。巧克力囊肿的患者，一级亲属的发病风险是无家族史者的7倍，可能是多基因遗传的影响。卵巢巧克力囊肿的发生和发展，也可能是患者免疫力低下、清除盆腔活性子宫内膜细胞能力减低的结果。巧克力卵巢囊肿的原因还可能与免疫耐受有关，机体把异位子宫内膜当成自体组织而不进行清除。

　　目前比较公认的是经血倒流种植学说：即女性在经期时子宫内膜腺上皮和间质细胞可随经血倒流，经输卵管进入腹腔，种植于卵巢和盆腔腹膜，并在该处继续生长和蔓延，形成盆腔内异症。先天性阴道闭锁或宫颈狭窄等经血潴留患者常并发内异症，说明经血倒流容易导致内膜种植。

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