支原体咳嗽和普通咳嗽在病因、症状表现、咳嗽特点、治疗药物、病程长短等方面存在差别。
1. 病因：支原体咳嗽是由支原体感染引起，支原体是一种介于细菌和病毒之间的微生物，它感染呼吸道后引发炎症，进而导致咳嗽。普通咳嗽的病因较为多样，可能是由病毒感染，如流感病毒、鼻病毒等；也可能是细菌感染，像肺炎链球菌等；还可能是过敏、异物刺激、环境因素等导致。
2. 症状表现：支原体咳嗽除了咳嗽症状外，还可能伴有发热，体温可高达38℃ - 39℃，发热可持续2 - 3周，同时可能有头痛、咽痛、肌肉酸痛等全身症状。普通咳嗽如果是病毒感染引起，可能伴有流涕、打喷嚏、鼻塞等上呼吸道症状；细菌感染时可能有咳痰，痰液可为黄色或白色脓性痰；过敏引起的咳嗽可能伴有鼻痒、眼痒、皮疹等过敏表现。
3. 咳嗽特点：支原体咳嗽多为刺激性干咳，咳嗽较为剧烈，夜间咳嗽明显加重，可持续较长时间，甚至可达数周。普通咳嗽的程度和性质因病因不同而异，病毒感染初期多为干咳，后期可能出现咳痰；细菌感染的咳嗽通常伴有较多痰液；过敏引起的咳嗽多为阵发性，接触过敏原后发作。
4. 治疗药物：针对支原体咳嗽，常用的治疗药物有阿奇霉素、罗红霉素、克拉霉素等大环内酯类抗生素，这些药物可以抑制支原体的生长和繁殖。普通咳嗽如果是病毒感染，一般以对症治疗为主，可使用右美沙芬、喷托维林等止咳药物；细菌感染时需要使用抗生素，如阿莫西林、头孢呋辛、左氧氟沙星等；过敏引起的咳嗽可使用氯雷他定、西替利嗪等抗组胺药物。但无论使用哪种药物，都需要遵医嘱。
5. 病程长短：支原体咳嗽的病程相对较长，一般需要2 - 3周甚至更长时间才能痊愈，如果治疗不及时或不彻底，还可能导致病情反复。普通咳嗽的病程因病因不同而有所差异，病毒感染引起的咳嗽通常在1 - 2周内缓解；细菌感染经过有效治疗后，咳嗽症状一般在1 - 2周内减轻；过敏引起的咳嗽，在脱离过敏原并进行适当治疗后，症状可较快缓解。
支原体咳嗽和普通咳嗽在多个方面存在明显差别。了解这些差别有助于准确判断咳嗽的病因，从而采取针对性的治疗措施。当出现咳嗽症状时，若无法自行判断，建议及时到正规医院的呼吸内科就诊，以便明确病因，获得科学有效的治疗。