怀孕后B超检查孕囊出现时间不同，可能与月经周期不规律、受精卵着床时间晚、胚胎发育迟缓、宫外孕、检测误差等因素有关。
1. 月经周期不规律：月经周期是女性生理周期的重要体现，正常情况下较为规律。但当月经周期不规律时，排卵时间会难以准确推算。若排卵推迟，受精卵形成的时间也会相应延后，即便怀孕时间从末次月经开始计算已有一定时长，但实际受精卵发育时间较短，在B超检查时就可能出现三周还不见孕囊的情况。
2. 受精卵着床时间晚：受精卵在输卵管内形成后，需要向子宫移动并着床。这个过程受到多种因素的影响，如输卵管蠕动功能、子宫内膜状态等。如果输卵管蠕动缓慢，或者子宫内膜容受性不佳，受精卵着床的时间就会推迟。着床晚意味着孕囊开始发育的时间也晚，所以在常规时间进行B超检查时，可能还看不到孕囊。
3. 胚胎发育迟缓：胚胎的发育受到遗传、环境、母体健康等多种因素的影响。若胚胎本身存在染色体异常等遗传问题，或者母体患有某些疾病，如甲状腺功能减退、严重的糖尿病等，会影响胚胎的正常发育，导致发育迟缓。发育迟缓的胚胎在B超下显示孕囊的时间会比正常情况晚。
4. 宫外孕：正常情况下，受精卵应该着床在子宫腔内。但当受精卵在子宫体腔以外的部位着床并发育时，就称为宫外孕，其中以输卵管妊娠最为常见。由于宫外的环境不利于孕囊的正常生长和发育，孕囊的生长速度和大小与宫内妊娠不同，在B超检查时，可能在子宫内看不到孕囊。同时，宫外孕还可能伴有腹痛、阴道流血等症状，需要引起重视。
5. 检测误差：B超检查的结果受到多种因素的影响，如检查设备的分辨率、检查医生的经验和操作手法等。如果检查设备的分辨率较低，或者医生在检查时没有准确找到孕囊的位置，可能会导致漏诊，出现三周还不见孕囊的假象。此外，怀孕早期孕囊较小，也可能因检查时的角度等问题而难以被发现。
怀孕后B超检查孕囊出现时间的差异是由多种因素共同作用的结果。当出现三周还不见孕囊的情况时，不必过于惊慌，但也不能掉以轻心。应及时就医，进行进一步的检查，如血HCG检查、复查B超等，以明确原因，并采取相应的处理措施。如果是月经周期不规律、受精卵着床晚等生理性因素导致的，可在医生的指导下定期复查；如果是胚胎发育迟缓、宫外孕等病理性因素导致的，则需要根据具体情况进行针对性的治疗。