服用双歧杆菌三联活菌胶囊时，饭前饭后选择重要，与胃酸影响、药物疗效、食物影响、肠道环境、个体差异等因素有关。
1. 胃酸影响：空腹时胃酸分泌较多，酸性环境较强。双歧杆菌三联活菌胶囊中的活菌对胃酸较为敏感，若在饭前服用，大量活菌可能会被胃酸杀灭，从而降低进入肠道发挥作用的活菌数量，影响药物效果。而饭后一段时间，胃酸因与食物混合，酸性相对减弱，此时服用胶囊，能减少胃酸对活菌的破坏，使更多活菌顺利到达肠道。
2. 药物疗效：饭后服用双歧杆菌三联活菌胶囊，药物可随着食物一起缓慢通过胃肠道，延长在肠道内的停留时间，有利于活菌在肠道黏膜表面定植和繁殖，更好地调节肠道菌群平衡，改善肠道功能，增强药物的治疗效果。
3. 食物影响：某些食物可能会影响双歧杆菌三联活菌胶囊的稳定性和活性。饭前胃内没有食物，药物可能会直接与胃黏膜接触，增加不良反应的发生风险。饭后服用，食物可以起到一定的缓冲作用，减少药物对胃黏膜的刺激，同时也能避免食物对药物的不良影响。
4. 肠道环境：饭后肠道蠕动相对活跃，消化液分泌增多，为双歧杆菌等有益菌提供了更适宜的生存和繁殖环境。此时服用胶囊，活菌能更快地适应肠道环境，发挥调节肠道微生态的作用，促进肠道健康。
5. 个体差异：不同人的胃肠道功能和对药物的反应存在差异。有些人胃肠道较为敏感，饭前服用可能会出现胃部不适、恶心等症状；而对于一些胃肠功能较好的人，饭前或饭后服用可能影响不大。但总体来说，为了保证药物效果和减少不良反应，大多数人更适合饭后服用。此外，除了双歧杆菌三联活菌胶囊，还有地衣芽孢杆菌活菌胶囊、枯草杆菌二联活菌颗粒、凝结芽孢杆菌活菌片等药物也常用于调节肠道菌群，使用时同样需考虑饭前饭后的问题，且都应遵医嘱。
综上所述，服用双歧杆菌三联活菌胶囊时，饭前饭后的选择对药物疗效和安全性有重要影响。一般情况下，饭后服用更有利于活菌发挥作用，减少胃酸对其的破坏，同时降低药物对胃肠道的刺激。但由于个体差异，具体服用时间应根据个人情况，在医生的指导下进行选择。