肠道菌群失调可通过一些药物调节改善，常用的有双歧杆菌四联活菌片、地衣芽孢杆菌活菌胶囊、酪酸梭菌肠球菌三联活菌片、布拉氏酵母菌散、枯草杆菌二联活菌颗粒等。
1. 双歧杆菌四联活菌片：主要由婴儿双歧杆菌、嗜酸乳杆菌、粪肠球菌、蜡样芽孢杆菌组成。它能补充肠道正常生理细菌，调整肠道菌群平衡，抑制并清除肠道中对人具有潜在危害的细菌。在临床上，对于因肠道菌群失调引起的腹泻、便秘、功能性消化不良等症状有较好的治疗效果。
2. 地衣芽孢杆菌活菌胶囊：该药物以地衣芽孢杆菌为主要成分。它可以促使机体产生抗菌活性物质，杀灭致病菌。同时，通过夺氧生物效应使肠道缺氧，有利于大量厌氧菌生长，调整肠道菌群失调，改善肠道微生态环境，从而缓解腹泻、腹胀等不适。
3. 酪酸梭菌肠球菌三联活菌片：含有酪酸梭菌、糖化菌、肠球菌活菌。酪酸梭菌在肠道内能产生一些有益物质，如维生素B族、维生素K等，有助于肠道黏膜的修复和再生。糖化菌能在肠道内发酵糖类产生乳酸，降低肠道pH值，抑制有害菌生长。肠球菌可在肠道内定植，增强肠道屏障功能，对急慢性腹泻、便秘等肠道菌群失调相关疾病有治疗作用。
4. 布拉氏酵母菌散：主要成分为冻干布拉氏酵母菌。它是一种真菌性益生菌，不受抗菌药物的影响，具有抗微生物和抗毒素作用，并对肠黏膜有营养作用。可用于治疗成人和儿童腹泻，以及肠道菌群失调所引起的腹泻症状。
5. 枯草杆菌二联活菌颗粒：包含枯草杆菌和肠球菌两种活菌。枯草杆菌能产生多种消化酶，帮助消化食物，促进营养物质的吸收。肠球菌可以在肠道内形成一层保护膜，阻止有害菌的侵袭。该药物可调节肠道菌群，改善肠道功能，常用于儿童肠道菌群失调引起的消化不良、食欲不振、腹泻、便秘等症状。
肠道菌群失调会给人体带来诸多不适，合理使用上述药物有助于调节肠道菌群，恢复肠道正常功能。但在使用这些药物时，务必遵医嘱，因为每个人的病情和身体状况不同，用药方案也会有所差异。如果肠道菌群失调症状持续不缓解或加重，应及时到正规医院消化内科就诊，以便明确病因，进行针对性治疗。