晨起咳嗽可能由多种因素引发，如环境刺激、上呼吸道感染、咳嗽变异性哮喘、胃食管反流病、慢性支气管炎等。
1. 环境刺激：夜间睡眠环境中可能存在灰尘、花粉、烟雾等刺激性物质，经过一夜的积累，早晨起床时呼吸道受到刺激，引发咳嗽。例如，卧室通风不良，空气不流通，尘螨等过敏原浓度增加，就容易刺激呼吸道黏膜，导致咳嗽。改善睡眠环境，保持室内清洁、通风，使用空气净化器等可以减少此类咳嗽的发生。
2. 上呼吸道感染：病毒或细菌感染引起的上呼吸道炎症，如感冒、咽炎、扁桃体炎等，炎症刺激呼吸道黏膜，导致分泌物增多，晨起时由于体位变化，分泌物刺激咽喉部，引发咳嗽。治疗上可根据感染类型遵医嘱使用抗病毒药物如利巴韦林、抗菌药物如阿莫西林、头孢呋辛等。
3. 咳嗽变异性哮喘：这是一种特殊类型的哮喘，以慢性咳嗽为主要或唯一临床表现。晨起时，人体的激素水平相对较低，气道反应性增高，容易诱发咳嗽。其发病机制与气道炎症和气道高反应性有关。治疗通常需要使用吸入性糖皮质激素如布地奈德、β₂受体激动剂如沙丁胺醇、白三烯调节剂如孟鲁司特钠等药物。
4. 胃食管反流病：夜间平卧睡眠时，胃酸容易反流至食管，甚至到达咽喉部，刺激咽喉黏膜，引起咳嗽。尤其是在晨起时，由于体位的改变，反流可能更加明显。患者除了咳嗽外，还可能伴有烧心、反酸等症状。治疗上可遵医嘱使用抑酸药物如奥美拉唑、兰索拉唑，促胃肠动力药物如多潘立酮、莫沙必利等。
5. 慢性支气管炎：是气管、支气管黏膜及其周围组织的慢性非特异性炎症。长期吸烟、空气污染等因素可导致气道慢性炎症，使气道分泌物增多。晨起时，由于体位变动，痰液移动刺激气道，引起咳嗽、咳痰。治疗时，稳定期可使用支气管扩张剂如氨茶碱、异丙托溴铵等，急性发作期可能需要使用抗菌药物控制感染。
晨起咳嗽看似是小问题，但可能隐藏着多种疾病隐患。不同原因导致的晨起咳嗽，其治疗方法也有所不同。如果晨起咳嗽持续不缓解或伴有发热、呼吸困难、咯血等其他症状，应及时到正规医院呼吸内科就诊，进行详细的检查，明确病因，并在医生的指导下进行规范治疗。