46岁月经推迟的基因奥秘涉及多个方面，包括FMR1基因变异、MCM8和MCM9基因异常、BRCA1和BRCA2基因突变、时钟基因改变、雌激素相关基因多态性等。
1. FMR1基因变异：FMR1基因与卵巢功能密切相关。该基因前突变时，可能会影响卵巢内卵泡的储备和发育，使得卵泡过早耗竭，进而导致月经周期出现改变，出现月经推迟的情况。研究发现，携带FMR1基因前突变的女性，卵巢功能衰退的风险增加，在46岁左右更容易出现月经推迟等异常表现。
2. MCM8和MCM9基因异常：MCM8和MCM9基因在DNA复制和修复过程中发挥重要作用。当这两个基因出现异常时，可能会影响卵巢细胞的正常增殖和分化，导致卵巢功能受损。卵巢功能下降后，激素分泌失衡，就可能引起月经推迟。有研究表明，MCM8和MCM9基因突变的女性，卵巢储备功能会明显降低，月经周期紊乱的发生率较高。
3. BRCA1和BRCA2基因突变：这两个基因主要与乳腺癌和卵巢癌的发生风险相关，但同时也对卵巢功能有一定影响。BRCA1和BRCA2基因参与了DNA损伤修复等重要生理过程，突变后可能导致卵巢组织的损伤和功能异常。在46岁这个年龄段，携带这两个基因突变的女性，卵巢功能可能会提前衰退，从而出现月经推迟的现象。
4. 时钟基因改变：人体的生物钟由一系列时钟基因调控，这些基因也参与了生殖内分泌系统的调节。时钟基因的改变可能会打乱下丘脑 - 垂体 - 卵巢轴的正常节律，影响激素的分泌和释放。例如，时钟基因的表达异常可能导致促性腺激素的分泌时间和量发生改变，进而影响卵泡的发育和排卵，最终导致月经推迟。
5. 雌激素相关基因多态性：雌激素在女性月经周期的调节中起着关键作用。雌激素相关基因的多态性会影响雌激素的合成、代谢和信号传导。某些基因多态性可能导致雌激素水平降低或作用减弱，使得子宫内膜的生长和脱落受到影响，从而出现月经推迟。例如，雌激素受体基因的多态性可能会改变受体与雌激素的亲和力，影响雌激素的生物学效应。
46岁月经推迟的基因奥秘是一个复杂的研究领域，涉及多个基因的作用。FMR1、MCM8、MCM9、BRCA1、BRCA2等基因的异常以及时钟基因改变、雌激素相关基因多态性等都可能影响卵巢功能和月经周期。深入了解这些基因奥秘，有助于更好地预测和干预女性月经异常的情况。对于出现月经推迟的46岁女性，建议及时到正规医院的妇产科就诊，进行相关检查，以明确原因，并在医生的指导下进行合理的治疗。可使用的药物有戊酸雌二醇、黄体酮胶囊、地屈孕酮片等，但用药需遵医嘱。