孩子咳嗽发烧的根本病因主要有呼吸道感染、过敏反应、环境因素、自身免疫性疾病、其他全身性疾病等。
1. 呼吸道感染：这是孩子咳嗽发烧最常见的原因。病毒感染如流感病毒、鼻病毒等，可引起上呼吸道感染，导致咳嗽、发热、流涕等症状；细菌感染如肺炎链球菌、金黄色葡萄球菌等，可引发支气管炎、肺炎等，也会出现咳嗽发烧的表现。支原体感染也较为常见，感染后咳嗽症状可能较为剧烈，发热可持续较长时间。
2. 过敏反应：孩子接触到过敏原，如花粉、尘螨、动物毛发等，可能引发过敏反应，出现咳嗽、打喷嚏、流鼻涕等症状，严重时也可能伴有低热。过敏引起的咳嗽通常较为顽固，脱离过敏原后症状可能会有所缓解。
3. 环境因素：环境温度过高或过低、空气干燥、空气污染等，都可能刺激孩子的呼吸道，导致咳嗽。如果孩子长时间处于这样的环境中，身体抵抗力下降，也容易出现发烧的情况。例如，冬季室内外温差大，孩子频繁进出，就容易引发不适。
4. 自身免疫性疾病：如幼年特发性关节炎、系统性红斑狼疮等自身免疫性疾病，也可能导致孩子出现咳嗽发烧的症状。这些疾病除了呼吸道症状外，还可能伴有其他系统的表现，如关节疼痛、皮疹等。
5. 其他全身性疾病：某些全身性疾病，如白血病、淋巴瘤等血液系统疾病，也可能以咳嗽发烧为首发症状。不过这类情况相对较少见，但需要引起重视。
针对孩子咳嗽发烧的防治策略，在预防方面，要注意保持室内空气流通，定期开窗通风；根据天气变化及时给孩子增减衣物；让孩子养成良好的个人卫生习惯，勤洗手；保证孩子充足的睡眠和合理的饮食，增强孩子的免疫力。在治疗方面，如果是呼吸道感染，病毒感染一般可使用利巴韦林、阿昔洛韦等抗病毒药物，细菌感染可选用阿莫西林、头孢克肟等抗生素，支原体感染则常用阿奇霉素、红霉素等药物。但用药必须遵医嘱。如果是过敏引起的，可使用氯雷他定、西替利嗪等抗过敏药物。对于环境因素引起的，要改善孩子的生活环境。如果怀疑是自身免疫性疾病或其他全身性疾病，应及时带孩子到正规医院就诊，进行详细的检查和诊断。
孩子咳嗽发烧的原因较为复杂，家长需要密切关注孩子的症状。当孩子出现咳嗽发烧时，要仔细观察伴随症状，初步判断可能的病因。如果症状较轻，可以先采取一些家庭护理措施；如果症状持续不缓解或加重，应及时就医，以便明确病因，进行针对性的治疗。同时，做好日常的预防工作，有助于减少孩子咳嗽发烧的发生。