儿童眼睫毛根部长小疙瘩可能由睑板腺囊肿、睑腺炎、睑缘炎、传染性软疣、粟丘疹等引起，会导致眼部不适、影响视力、引发感染等危害，处理方法包括热敷、药物治疗、手术治疗等。
1. 睑板腺囊肿：是睑板腺特发性无菌性慢性肉芽肿性炎症，通常是由于睑板腺出口阻塞，腺体的分泌物潴留在睑板内，对周围组织产生慢性刺激而引起。表现为眼睑皮下圆形肿块，一般无疼痛。小的囊肿可自行吸收，但也可能长期不变或逐渐增大。若囊肿较大，可能会压迫眼球，引起散光，影响视力。早期可通过热敷，促进囊肿吸收。若热敷效果不佳，可考虑手术切除。
2. 睑腺炎：又称麦粒肿，是眼睑腺体的急性化脓性炎症，多由葡萄球菌感染引起。患处呈红、肿、热、痛等急性炎症表现。疼痛程度常与水肿程度呈正相关。如果不及时治疗，炎症可能会扩散，导致眼睑蜂窝织炎，严重时可引起败血症或海绵窦血栓形成等严重并发症。治疗上，早期可热敷，局部使用抗生素滴眼液，如左氧氟沙星滴眼液、妥布霉素滴眼液、氯霉素滴眼液等，遵医嘱用药。当脓肿形成后，应切开排脓。
3. 睑缘炎：是睑缘表面、睫毛毛囊及其腺体组织的亚急性或慢性炎症。可分为鳞屑性、溃疡性和眦部睑缘炎。患者会感觉眼部发痒、刺痛和烧灼感。长期不愈可导致睑缘肥厚，泪小点外翻而引起溢泪。治疗时，需去除诱因和避免刺激因素，如矫正屈光不正，治疗全身慢性病等。清洁睑缘，局部使用抗生素眼膏，如红霉素眼膏、金霉素眼膏、四环素眼膏等，遵医嘱使用。
4. 传染性软疣：是由传染性软疣病毒感染引起的一种传染性皮肤病。表现为蜡样光泽的丘疹或结节，顶端凹陷，能挤出乳酪状软疣小体。若发生在眼睫毛根部，搔抓后可能会引起自身接种，导致皮疹增多。治疗主要是用消毒镊子夹除软疣小体，然后涂以碘酊等以防细菌感染。
5. 粟丘疹：起源于表皮或附属器上皮的良性肿物或潴留性囊肿。表现为黄白色、坚实的丘疹，表面光滑，直径1-2毫米。一般无自觉症状。通常不需要特殊治疗，如有美容需求，可在局部消毒后用针挑破表皮，剔出黄白色小颗粒。
儿童眼睫毛根部长小疙瘩可能是多种疾病的表现，每种疾病都有其相应的危害和处理方法。家长发现孩子眼睫毛根部长小疙瘩时，应及时带孩子到正规医院的眼科就诊，明确病因，在医生的指导下进行治疗，避免延误病情，造成更严重的后果。