腹部两侧隐隐作痛可能由多种原因引起，如肠道功能紊乱、泌尿系统结石、妇科疾病、肌肉拉伤、腹膜炎等。
1. 肠道功能紊乱：肠道功能紊乱是较为常见的原因之一。饮食不规律、食用过多辛辣刺激食物、腹部着凉等都可能引发。肠道正常的蠕动节律被打乱，导致肠道痉挛，从而出现腹部两侧隐痛。患者可能还会伴有腹胀、腹泻或便秘等症状。治疗上，可使用双歧杆菌四联活菌片调节肠道菌群，复方消化酶胶囊促进消化，匹维溴铵片缓解肠道痉挛。同时，要注意规律饮食，避免食用刺激性食物，做好腹部保暖。
2. 泌尿系统结石：泌尿系统结石包括肾结石、输尿管结石等。当结石在泌尿系统移动时，可能会划伤尿路黏膜，引起腹部两侧隐痛，疼痛有时会向会阴部放射。患者还可能出现血尿、尿频、尿急等症状。对于较小的结石，可通过服用排石颗粒、肾石通颗粒等药物促进结石排出，同时大量饮水，多做跳跃运动。如果结石较大，可能需要采取体外冲击波碎石或手术治疗。
3. 妇科疾病：女性腹部两侧隐痛可能与妇科疾病有关，如附件炎、卵巢囊肿等。附件炎是指输卵管和卵巢的炎症，炎症刺激周围组织，导致腹部两侧疼痛。卵巢囊肿如果发生蒂扭转、破裂等情况，也会引起疼痛。对于附件炎，可使用头孢克肟分散片、甲硝唑片等抗生素进行抗感染治疗。卵巢囊肿如果较小，可定期观察；如果较大或出现并发症，可能需要手术切除。
4. 肌肉拉伤：剧烈运动、突然的扭转动作等可能导致腹部两侧肌肉拉伤。肌肉纤维受损后，会出现炎症反应，引起隐痛。患者通常有明确的运动损伤史，疼痛在活动或按压时加重。治疗上，应注意休息，避免剧烈运动。在受伤后的24小时内可进行冷敷，24小时后可进行热敷，还可使用云南白药膏、活血止痛膏等药物促进血液循环，缓解疼痛。
5. 腹膜炎：腹膜炎是一种较为严重的情况，通常由细菌感染、化学刺激等引起。炎症刺激腹膜，导致腹部两侧疼痛，疼痛一般较为剧烈，还可能伴有发热、恶心、呕吐等症状。治疗上需要使用抗生素控制感染，如阿莫西林胶囊、左氧氟沙星片等。如果病情严重，可能需要手术治疗。
腹部两侧隐隐作痛的原因多样，不同原因的治疗方法也有所不同。当出现这种症状时，应仔细观察自身症状，结合可能的诱发因素进行初步判断。但由于病情较为复杂，建议及时到正规医院就诊，进行详细的检查，以明确病因，并在医生的指导下进行规范治疗，避免延误病情。