卵巢囊肿疼痛难忍时，桂枝茯苓丸有一定止痛作用，这与其活血、化瘀、消癥的功效有关，不过其止痛效果受囊肿性质、大小、疼痛程度、个体差异、联合用药情况等因素影响。
1. 囊肿性质：卵巢囊肿有生理性和病理性之分。生理性囊肿多在月经周期特定阶段出现，一般可自行消失，疼痛通常较轻微。桂枝茯苓丸对于这类囊肿引起的疼痛，可能通过调节身体气血运行，起到一定缓解作用。病理性囊肿如巧克力囊肿、畸胎瘤等，病因较为复杂，桂枝茯苓丸虽有一定的调理作用，但对于严重的疼痛，可能无法完全止痛。
2. 囊肿大小：较小的卵巢囊肿，对周围组织的压迫和刺激相对较轻，疼痛程度也相对较低。桂枝茯苓丸可以改善局部血液循环，减轻囊肿对周围组织的不良影响，从而缓解疼痛。而较大的囊肿，可能已经对卵巢、输卵管等周围组织造成了明显的压迫和损伤，疼痛较为剧烈，此时仅依靠桂枝茯苓丸可能难以达到理想的止痛效果。
3. 疼痛程度：如果卵巢囊肿引起的疼痛是轻度的隐痛或胀痛，桂枝茯苓丸可能通过其活血化瘀的作用，改善局部气血不畅的状况，从而缓解疼痛。但如果疼痛难忍，达到了中重度疼痛，可能意味着囊肿出现了破裂、扭转等紧急情况，此时桂枝茯苓丸的止痛作用就十分有限，需要及时就医进行手术等治疗。
4. 个体差异：不同的人对药物的反应存在差异。有些人可能对桂枝茯苓丸较为敏感，服用后能较好地发挥其药效，缓解疼痛。而另一些人可能由于体质、代谢等因素，对药物的吸收和利用效果不佳，导致止痛效果不明显。此外，个体的心理状态、生活习惯等也可能影响药物的疗效。
5. 联合用药情况：在治疗卵巢囊肿疼痛时，桂枝茯苓丸可以与其他药物联合使用，以增强止痛效果。例如，与非甾体类抗炎药如布洛芬、萘普生、双氯芬酸等联合使用，能在一定程度上提高止痛效果。但联合用药必须在医生的指导下进行，避免药物相互作用产生不良反应。
综上所述，卵巢囊肿疼痛难忍时，桂枝茯苓丸可能有一定的止痛作用，但受到多种因素的影响。在出现卵巢囊肿疼痛难忍的情况时，不能单纯依赖桂枝茯苓丸止痛，应及时到正规医院妇产科就诊，明确囊肿的性质、大小等情况，在医生的指导下进行规范治疗。同时，使用任何药物都需遵医嘱。