头疼低烧可能由上呼吸道感染、流感、鼻窦炎、脑膜炎、自主神经功能紊乱等因素引起，可通过一般治疗、药物治疗等方法缓解。
1.上呼吸道感染：这是引起头疼低烧常见的原因之一。主要由病毒感染所致，当病毒入侵人体后，免疫系统会启动防御机制，产生炎症反应，进而出现头疼、低烧等症状。一般治疗方面，要注意休息，保证充足睡眠，多喝水，促进新陈代谢。药物治疗可选择复方氨酚烷胺胶囊、氨咖黄敏胶囊、酚麻美敏片等，以缓解症状，但需遵医嘱使用。
2.流感：由流感病毒引起，起病较急。病毒在体内大量繁殖，释放毒素，刺激神经和体温调节中枢，导致头疼和低烧。除了一般的休息和多饮水外，抗病毒药物如奥司他韦、扎那米韦、帕拉米韦等可在医生指导下使用，能有效抑制病毒复制，缩短病程。
3.鼻窦炎：鼻窦发生炎症时，鼻窦内会出现积液，压力升高，刺激周围神经，引起头疼。同时炎症也会导致低烧。治疗上，可使用生理盐水冲洗鼻腔，以清除分泌物，减轻炎症。药物方面，可选用阿莫西林、头孢呋辛、罗红霉素等抗生素控制感染，还可配合使用布地奈德鼻喷雾剂等减轻鼻黏膜炎症和水肿。
4.脑膜炎：这是较为严重的情况，细菌、病毒等病原体感染脑膜，引发炎症。炎症刺激脑膜和神经，导致剧烈头疼，同时伴有低烧。一旦怀疑是脑膜炎，需及时就医，进行腰椎穿刺等检查明确诊断。治疗通常需要使用抗生素如头孢曲松、头孢噻肟等，或抗病毒药物如阿昔洛韦、更昔洛韦等，具体用药需根据病原体类型由医生确定。
5.自主神经功能紊乱：长期精神紧张、压力过大、焦虑等因素可导致自主神经功能紊乱，影响体温调节和神经功能，出现头疼低烧症状。一般治疗包括调整生活方式，保持心情舒畅，适当进行体育锻炼。药物治疗可选用谷维素、维生素B1、甲钴胺等调节神经功能的药物。
头疼低烧可能由多种原因引起，不同原因的治疗方法有所不同。在出现头疼低烧症状时，可先进行一般的休息和观察，若症状持续不缓解或加重，应及时前往正规医院就诊，明确病因，并在医生的指导下进行针对性治疗。同时，使用药物时一定要严格遵医嘱，避免自行用药带来不良后果。