低烧拉肚子的根源主要有肠道感染、食物中毒、全身性感染、自身免疫性疾病、药物副作用等。
1. 肠道感染：这是较为常见的原因。病毒感染如轮状病毒、诺如病毒等，可侵袭肠道黏膜，破坏肠道正常的消化和吸收功能，导致肠道蠕动加快，出现拉肚子症状，同时身体免疫系统会启动防御机制，引发低烧。细菌感染如大肠杆菌、沙门氏菌等，细菌在肠道内大量繁殖并释放毒素，刺激肠道黏膜，引起炎症反应，进而导致低烧和拉肚子。寄生虫感染如阿米巴原虫、贾第虫等，它们在肠道内寄生，损伤肠道组织，影响肠道的正常生理功能，也会出现相应症状。针对肠道感染，可使用蒙脱石散止泻，调节肠道菌群可选用双歧杆菌四联活菌片，若为细菌感染，可遵医嘱使用诺氟沙星等抗生素治疗。
2. 食物中毒：食用了被细菌、毒素、有毒物质污染或变质的食物后，毒素进入人体，刺激胃肠道，引起胃肠道的炎症反应。常见的有变质的肉类、海鲜等，患者通常在进食后数小时内出现低烧、拉肚子的症状，还可能伴有呕吐、腹痛等表现。治疗时，首先要催吐、洗胃，以减少毒素吸收，同时可使用黄连素、颠茄磺苄啶片等药物缓解症状。
3. 全身性感染：除了肠道局部感染外，全身性感染也可能导致低烧拉肚子。例如伤寒，是由伤寒杆菌引起的急性全身性传染病，细菌随血流播散至全身各器官，可侵犯肠道淋巴组织，引起肠道病变，出现低烧、相对缓脉、全身不适、拉肚子等症状。疟疾也可出现类似情况，疟原虫在体内繁殖，破坏红细胞，释放毒素，影响身体的正常代谢和免疫功能，部分患者会伴有胃肠道症状，如拉肚子。治疗伤寒可选用氯霉素、头孢曲松等药物，疟疾可使用青蒿素、氯喹等药物。
4. 自身免疫性疾病：如溃疡性结肠炎，是一种病因尚不十分清楚的结肠和直肠慢性非特异性炎症性疾病，免疫系统错误地攻击自身肠道组织，导致肠道黏膜炎症、溃疡形成，患者会出现反复发作的拉肚子、黏液脓血便，同时可伴有低烧、腹痛等症状。克罗恩病也是一种慢性炎症性肠病，可累及全消化道，炎症刺激肠道，影响肠道的吸收和蠕动功能，引起低烧、拉肚子等表现。治疗这类疾病，常用药物有柳氮磺吡啶、美沙拉嗪、泼尼松等。
5. 药物副作用：某些药物在使用过程中可能会出现副作用，导致低烧拉肚子。例如抗生素，长期或大量使用后可能破坏肠道内的正常菌群平衡，引起肠道功能紊乱，出现拉肚子症状，部分患者还可能伴有低烧。化疗药物也会对胃肠道黏膜产生刺激和损伤，影响胃肠道的正常功能，导致类似症状。如果因药物副作用出现这些症状，需要及时告知医生，调整用药方案，同时可使用一些保护肠道黏膜的药物，如复方谷氨酰胺肠溶胶囊等。
低烧拉肚子可能由多种原因引起，肠道感染、食物中毒、全身性感染、自身免疫性疾病、药物副作用等都可能是根源。当出现这些症状时，应及时就医，通过详细的检查明确病因，然后进行针对性治疗。在治疗过程中，要严格遵医嘱用药，同时注意饮食卫生和休息，以促进身体的康复。