头孢克洛和头孢克肟虽同属头孢类抗生素，但抗菌谱、适用疾病、药代动力学、不良反应、药物相互作用等方面存在差异，用错可能导致治疗无效、病情延误、不良反应增加、细菌耐药性产生、影响其他药物疗效等严重后果。
1. 抗菌谱差异：头孢克洛对革兰阳性菌的抗菌作用较强，如金黄色葡萄球菌、肺炎链球菌等；而头孢克肟对革兰阴性菌的抗菌活性更好，像大肠杆菌、肺炎克雷伯菌等。若用错，针对感染菌的治疗效果会大打折扣，例如本该用头孢克肟治疗大肠杆菌感染，却用了头孢克洛，可能无法有效抑制细菌生长，导致治疗无效。
2. 适用疾病不同：头孢克洛常用于治疗呼吸道感染、皮肤软组织感染等；头孢克肟更常用于治疗泌尿系统感染、耳鼻喉感染等。如果不根据具体疾病选择合适药物，可能延误病情，比如泌尿系统感染患者使用头孢克洛，可能不能及时控制炎症，使病情加重。
3. 药代动力学区别：头孢克洛口服后吸收迅速，但在体内维持有效血药浓度的时间相对较短；头孢克肟吸收相对较慢，但血药浓度维持时间长。用错药物可能无法在合适的时间达到有效的治疗浓度，影响治疗效果。
4. 不良反应差异：两种药物的不良反应有所不同。头孢克洛可能导致恶心、呕吐、腹泻等胃肠道反应相对较为常见；头孢克肟除胃肠道反应外，还可能引起过敏反应等。用错药物可能增加不良反应的发生几率，给患者带来更多不适。
5. 药物相互作用：头孢克洛与一些药物合用时可能发生相互作用，影响药效或增加不良反应；头孢克肟也有其特定的药物相互作用情况。如果用错药物，同时又正在使用其他药物，可能会导致药物相互作用的不良后果，影响其他药物的疗效或增加毒性。
6. 细菌耐药性：不合理使用药物，包括用错头孢克洛和头孢克肟，会促使细菌产生耐药性。一旦细菌产生耐药性，后续治疗会变得更加困难，可能需要使用更强效、更昂贵的抗生素。
头孢克洛和头孢克肟在多个方面存在差异，用错药物会带来一系列严重后果。因此，在使用这两种药物时，必须严格遵循医生的建议，根据具体病情、感染菌类型等因素合理选择药物，以确保治疗效果，减少不良反应的发生，避免细菌耐药性的产生。如果对药物使用有任何疑问，应及时咨询专业医生。