高烧40度时，物理降温与药物降温哪个更快受多种因素影响，包括降温原理、起效时间、适用人群、降温持续时间、副作用等。
1. 降温原理：物理降温是通过传导、对流、蒸发等物理方法带走身体热量，如用湿毛巾敷额头、温水擦浴、使用退热贴等。药物降温则是通过药物作用于体温调节中枢，使散热增加、产热减少，从而降低体温，常用药物有对乙酰氨基酚、布洛芬、阿司匹林等。
2. 起效时间：一般来说，药物降温起效相对较快。口服退烧药后，通常在半小时到一小时左右开始起效，体温逐渐下降。而物理降温起效相对较慢，需要持续一段时间才能看到明显效果，可能需要十几分钟甚至半小时以上。
3. 适用人群：物理降温适用于大多数人群，尤其是儿童、孕妇、老人以及不能耐受药物的人。药物降温虽然效果较好，但部分人群可能不适用，如对某些药物过敏者、肝肾功能不全者等。而且儿童用药需要根据年龄和体重严格选择合适的药物和剂型。
4. 降温持续时间：药物降温的持续时间相对较长，一次用药后体温可能在数小时内维持在较低水平。物理降温的持续时间较短，如果不持续进行，体温容易再次升高。例如，用湿毛巾敷额头，当毛巾温度与体温接近时，就需要更换毛巾才能继续发挥降温作用。
5. 副作用：物理降温一般没有明显副作用，但如果方法不当，可能会引起一些不适，如用冷水擦浴可能导致寒战，反而使体温升高。药物降温可能会有一些副作用，如对乙酰氨基酚可能会引起恶心、呕吐等胃肠道反应，布洛芬可能会导致胃肠道溃疡、出血等，阿司匹林可能会引起瑞氏综合征等严重不良反应。
高烧40度时，物理降温与药物降温各有优缺点。药物降温起效相对较快、持续时间较长，但可能存在副作用且部分人群不适用；物理降温安全性高、适用人群广，但起效慢、持续时间短。在实际应用中，可根据具体情况选择合适的降温方法，也可将两者结合使用。如果高烧持续不退或伴有其他严重症状，应及时到正规医院就诊。