儿童咳嗽发烧的病因多样，主要有上呼吸道感染、下呼吸道感染、支气管炎、肺炎、感染性疾病等。
1. 上呼吸道感染：这是儿童咳嗽发烧常见病因之一，多由病毒感染引起，如鼻病毒、流感病毒等。病毒入侵鼻腔、咽或喉部，引发炎症反应，刺激呼吸道黏膜，导致咳嗽，同时免疫系统对抗病毒时会使体温升高。一般症状较轻，可能伴有鼻塞、流涕等。治疗上，可使用小儿氨酚黄那敏颗粒缓解症状，也可服用利巴韦林颗粒进行抗病毒治疗，用药需遵医嘱。
2. 下呼吸道感染：相较于上呼吸道感染，下呼吸道感染病情可能更严重。细菌、支原体等病原体易侵犯下呼吸道。炎症刺激气管、支气管等部位，引起咳嗽反射。发烧程度不一，可能持续时间较长。可选用阿奇霉素干混悬剂治疗支原体感染，头孢克肟颗粒治疗细菌感染，具体用药应遵循医生建议。
3. 支气管炎：通常由上呼吸道感染蔓延所致，气管、支气管黏膜及其周围组织发生炎症。炎症产生的分泌物刺激呼吸道，导致咳嗽。炎症反应会引起身体发热。可使用氨溴特罗口服溶液止咳化痰，配合使用阿莫西林克拉维酸钾颗粒抗感染，用药要遵医嘱。
4. 肺炎：肺部受到细菌、病毒或支原体等病原体侵袭，引发炎症。炎症影响肺部气体交换功能，刺激呼吸道产生咳嗽。患儿可能出现高热、呼吸急促等症状。针对不同病原体，可分别选用头孢呋辛酯片、利巴韦林注射液、罗红霉素颗粒等药物治疗，但都需在医生指导下使用。
5. 感染性疾病：如猩红热、麻疹等感染性疾病也会导致儿童咳嗽发烧。这些疾病由特定病原体感染引起，除咳嗽发烧外，还会有各自的典型症状，如猩红热会出现皮疹，麻疹会有口腔黏膜斑等。治疗时需根据具体疾病，使用相应的抗感染药物，如青霉素治疗猩红热等，用药必须严格遵医嘱。
儿童咳嗽发烧病因复杂，不同病因的治疗方法和用药有所不同。当儿童出现咳嗽发烧症状时，家长应密切观察病情，及时带孩子到正规医院就诊，明确病因后，在医生的指导下合理用药，切勿自行给孩子用药，以免延误病情或引发不良反应。