怀孕初期流血肚子疼可能由多种因素引起，如先兆流产、宫外孕、葡萄胎、宫颈病变、生理性出血等。
1. 先兆流产：这是怀孕初期较为常见的导致流血肚子疼的原因。通常是由于胚胎染色体异常、母体激素水平不足、感染等因素引起。胚胎着床不稳定，可能会出现少量阴道流血，常为暗红色或血性白带，随后可能伴有阵发性下腹部疼痛或腰背痛。治疗上，一般需要卧床休息，医生可能会根据具体情况使用黄体酮胶囊、地屈孕酮片、固肾安胎丸等药物进行保胎治疗，以提高体内孕激素水平，维持妊娠。
2. 宫外孕：指受精卵在子宫体腔以外着床，最常见的是输卵管妊娠。随着胚胎的生长，会使输卵管壁膨胀、破裂，导致腹腔内出血，引起剧烈腹痛和阴道流血。宫外孕是一种较为危险的情况，如果不及时治疗，可能会危及孕妇生命。一旦确诊，通常需要采取手术治疗，如输卵管开窗术、输卵管切除术等。
3. 葡萄胎：是一种异常的妊娠情况，胎盘绒毛滋养细胞增生，间质水肿，形成大小不一的水泡，形似葡萄。患者会出现阴道流血，量多少不定，有时可伴有水泡样组织排出，同时可能伴有腹痛。葡萄胎确诊后，需要及时进行清宫手术，术后还需要定期复查血HCG水平，以监测病情变化。
4. 宫颈病变：如宫颈炎、宫颈息肉等宫颈疾病，也可能导致怀孕初期出现阴道流血。宫颈炎是由于病原体感染宫颈引起的炎症，炎症刺激可能导致宫颈黏膜充血、水肿，容易出现接触性出血。宫颈息肉是宫颈管黏膜局部增生形成的良性赘生物，质地脆嫩，容易出血。对于宫颈炎，可根据病原体类型选择合适的抗生素治疗，如阿奇霉素、头孢克肟、甲硝唑等；宫颈息肉一般可在孕中期进行手术摘除。
5. 生理性出血：部分孕妇在受精卵着床时，可能会出现少量阴道流血，一般为淡红色或褐色，持续时间较短，通常不伴有腹痛或仅有轻微的腹部不适。这种情况一般不需要特殊处理，注意休息即可。
怀孕初期流血肚子疼是一个需要引起重视的问题，可能涉及多种不同的情况。无论是哪种原因导致的，孕妇一旦出现此类症状，都应及时到正规医院的妇产科就诊，进行详细的检查，如B超检查、血HCG检查、孕酮检查等，以明确病因，并在医生的指导下进行相应的治疗。早期诊断和及时治疗对于保障孕妇和胎儿的健康至关重要。