传统治疗与注射用更昔洛韦治疗在治疗病毒感染性疾病时效果存在差异，主要体现在治疗机制、适用范围、治疗针对性、副作用以及治疗周期等方面。
1. 治疗机制：传统治疗可能采用多种方式，如使用一些具有抗病毒作用的中药，通过调节人体的整体机能，增强机体的抵抗力来对抗病毒；或者使用一些常规的对症治疗药物，缓解疾病带来的症状。而注射用更昔洛韦是一种合成的核苷类抗病毒药物，它能够竞争性抑制病毒DNA多聚酶，并直接掺入病毒DNA链中，终止病毒DNA链的延长，从而达到抑制病毒复制的目的。
2. 适用范围：传统治疗适用于多种疾病，包括一些病毒感染性疾病，但对于某些特定的病毒感染，其效果可能有限。注射用更昔洛韦主要用于预防及治疗免疫功能缺陷患者的巨细胞病毒感染，如艾滋病患者、接受器官移植的患者等发生的巨细胞病毒视网膜炎、肺炎等疾病。
3. 治疗针对性：传统治疗往往是综合调理，对多种症状有一定的缓解作用，但针对性相对较弱。注射用更昔洛韦对巨细胞病毒等特定病毒具有较强的针对性，能够更精准地抑制病毒的复制和传播。
4. 副作用：传统治疗如果使用中药等，副作用相对较小，但可能存在个体差异。而注射用更昔洛韦可能会引起一些不良反应，如骨髓抑制，表现为中性粒细胞减少、血小板减少等；还可能出现胃肠道反应，如恶心、呕吐、腹泻等；此外，还可能有肝功能损害、肾功能损害等。
5. 治疗周期：传统治疗可能需要较长的时间来调理身体，达到治疗效果，治疗周期相对较长。注射用更昔洛韦在治疗特定病毒感染时，起效相对较快，能够在较短时间内控制病毒的复制，但具体的治疗周期也需要根据患者的病情和身体状况来确定。
6. 联合用药情况：传统治疗可能会采用多种药物联合使用，以达到更好的治疗效果。注射用更昔洛韦在治疗过程中，有时也需要与其他药物联合使用，如免疫调节剂等，以提高患者的免疫力，增强治疗效果。
传统治疗与注射用更昔洛韦治疗在治疗病毒感染性疾病时各有特点。传统治疗注重整体调理，副作用相对较小，但针对性和起效速度可能不如注射用更昔洛韦。注射用更昔洛韦对特定病毒具有较强的抑制作用，起效较快，但也存在一定的副作用。在临床治疗中，应根据患者的具体病情、身体状况等因素，综合考虑选择合适的治疗方法。无论选择哪种治疗方式，都应在医生的指导下进行，以确保治疗的安全和有效。