运动不当可能会引发一只眼睛眨眼痛，常见因素包括眼部疲劳、外伤、感染、眼压变化、过敏反应等。
1. 眼部疲劳：运动时如果长时间过度用眼，比如长时间盯着运动器械、屏幕等，可能会导致单眼疲劳。眼睛持续处于紧张状态，眼肌痉挛，泪液分泌减少，从而引起眨眼时疼痛。例如在进行室内健身时，一直专注于跑步机上的显示屏幕，就可能使单眼出现疲劳性疼痛。
2. 外伤：运动过程中，眼睛可能会受到意外撞击或擦伤。如打篮球时被球击中眼睛，或者在户外运动时被树枝等划伤眼睛。这种外伤可能损伤到眼睑、结膜、角膜等眼部组织，导致眨眼时受伤部位受到刺激，产生疼痛感。
3. 感染：运动后如果不注意眼部卫生，用脏手揉眼睛，可能会使细菌、病毒等病原体侵入眼部，引发感染。常见的如结膜炎、角膜炎等。感染会导致眼部出现炎症反应，表现为眼睛红肿、疼痛、分泌物增多等症状，眨眼时疼痛会更加明显。
4. 眼压变化：剧烈运动可能会引起眼压的波动。对于一些本身眼部结构较为特殊的人群，如青光眼患者的潜在人群，运动不当可能导致眼压急剧升高。过高的眼压会压迫眼球内的神经和组织，引起眼睛疼痛，且可能仅在单眼出现症状。
5. 过敏反应：运动环境中可能存在各种过敏原，如花粉、灰尘等。当眼睛接触到这些过敏原时，可能会引发过敏反应。过敏会导致眼部瘙痒、红肿、疼痛等症状，有时可能仅累及一只眼睛，从而出现眨眼痛的情况。
6. 干眼症：运动时，尤其是在干燥、多风的环境中，眼睛表面的泪液容易蒸发过快。如果泪液分泌不足或泪膜不稳定，就会导致干眼症。干眼症会使眼睛感到干涩、刺痛，眨眼时疼痛加剧，且可能单眼症状更为明显。
7. 神经牵涉痛：运动时身体的某些部位肌肉紧张或受伤，可能会通过神经传导引起眼部牵涉痛。例如颈部肌肉过度紧张，可能会刺激颈部神经，进而影响到支配眼部的神经，导致单眼眨眼时出现疼痛。
运动不当是有可能引发一只眼睛眨眼痛的，原因多种多样。当出现这种症状时，应及时关注眼部状况。如果疼痛较轻，可以先适当休息，观察症状是否缓解。若疼痛持续不缓解或加重，应及时前往正规医院的眼科就诊，进行详细的检查，以明确病因，并在医生的指导下进行相应的治疗。治疗药物方面，常见的有左氧氟沙星滴眼液、妥布霉素滴眼液、玻璃酸钠滴眼液等，但具体用药需遵医嘱。