3个月宝宝咳嗽，可通过保证充足母乳、补充维生素、摄入益生菌、增加水分摄入、适当补充矿物质等营养调理方式改善。

1. 保证充足母乳：母乳是3个月宝宝最好的食物，含有丰富的免疫球蛋白、乳铁蛋白等营养成分，能够增强宝宝的免疫力，有助于缓解咳嗽症状。同时，母乳的温度和成分适宜，易于宝宝消化吸收。

2. 补充维生素：维生素C具有抗氧化作用，能够增强宝宝的抵抗力，可以通过给宝宝喝鲜榨的苹果汁、橙子汁等富含维生素C的果汁来补充。维生素A对维持呼吸道黏膜的完整性有重要作用，可以在医生指导下给宝宝补充适量的维生素A制剂。

3. 摄入益生菌：益生菌有助于调节宝宝肠道菌群平衡，增强肠道免疫力，进而提高身体整体的抵抗力。常见的益生菌有双歧杆菌、嗜酸乳杆菌、酪酸梭菌等，可在医生建议下给宝宝适当补充。

4. 增加水分摄入：多给宝宝喝温开水，能够湿润呼吸道，稀释痰液，促进痰液排出，从而减轻咳嗽症状。可以少量多次地给宝宝喂水。

5. 适当补充矿物质：锌元素对宝宝的免疫系统发育和功能维持有重要作用，缺乏锌可能会导致宝宝免疫力下降。可以在医生的指导下给宝宝补充葡萄糖酸锌、硫酸锌等锌制剂。铁元素对于宝宝的造血功能和免疫功能也很重要，缺铁可能会引起贫血，影响宝宝的健康。可以通过给宝宝服用富马酸亚铁、琥珀酸亚铁等铁剂来补充铁元素。

3个月宝宝咳嗽时，通过合理的营养调理能够在一定程度上改善症状。保证充足母乳、补充维生素、摄入益生菌、增加水分摄入以及适当补充矿物质等方法，都有助于增强宝宝的免疫力，缓解咳嗽。但如果宝宝咳嗽症状持续不缓解或加重，应及时带宝宝到正规医院的小儿科就诊，在医生的指导下进行治疗。同时，使用任何药物都需严格遵医嘱。

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