怀孕三个月后孕吐加重可能存在多种隐患，如激素水平变化、甲状腺功能异常、胃肠道疾病、多胎妊娠、妊娠期肝内胆汁淤积症等。
1. 激素水平变化：怀孕后体内激素水平会发生显著改变，在怀孕三个月后，若激素水平波动较大，如人绒毛膜促性腺激素（hCG）持续处于较高水平，可能会对胃肠道产生刺激，进而导致孕吐加重。这种情况下，身体需要一定时间来适应激素的变化，一般可通过适当休息、调整饮食来缓解。
2. 甲状腺功能异常：甲状腺功能亢进或减退都可能影响孕妇的代谢和内分泌系统。甲状腺激素分泌异常会干扰胃肠道的正常蠕动和消化功能，从而使孕吐症状加剧。对于甲状腺功能异常的孕妇，可能需要使用丙硫氧嘧啶、甲巯咪唑等药物进行治疗，但必须遵医嘱。
3. 胃肠道疾病：孕妇在孕期免疫力相对较低，容易患上胃肠道疾病，如胃炎、胃溃疡等。这些疾病会导致胃肠道黏膜受损，消化功能减弱，食物在胃内停留时间延长，引起恶心、呕吐等症状加重。治疗时可能会用到铝碳酸镁、奥美拉唑、枸橼酸铋钾等药物，具体用药需遵循医生建议。
4. 多胎妊娠：怀有双胞胎或多胞胎的孕妇，体内的激素水平和子宫压力相对单胎妊娠更高，对胃肠道的压迫也更明显，这会增加孕吐的严重程度。多胎妊娠的孕妇需要更加密切地关注自身身体状况，定期产检，确保母婴健康。
5. 妊娠期肝内胆汁淤积症：这是一种妊娠期特有的并发症，主要表现为胆汁酸升高。胆汁酸在体内蓄积会对胃肠道和神经系统产生刺激，导致孕吐加重，同时还可能伴有皮肤瘙痒等症状。治疗时可能会使用熊去氧胆酸等药物，以降低胆汁酸水平，缓解症状，但用药必须在医生指导下进行。
怀孕三个月后孕吐加重可能是由多种隐患引起的。孕妇若出现这种情况，应及时就医，进行相关检查，以明确病因，并采取相应的治疗措施。在治疗过程中，务必严格遵医嘱用药，同时注意休息和饮食调整，以保障自身和胎儿的健康。