囊胚和冻胚在形成过程、培养时间、移植成功率、细胞数量与结构、保存方式等方面存在关键差异。
1. 形成过程：囊胚是受精卵在体外培养发育至第5 - 7天形成的胚胎，这一阶段的胚胎已经经历了多次细胞分裂，开始出现细胞分化，形成了内细胞团和滋养层细胞。而冻胚是将培养到一定阶段的胚胎，包括卵裂期胚胎或囊胚，采用冷冻技术保存起来的胚胎。这些胚胎可以是新鲜周期中多余的胚胎，也可以是为后续移植周期准备而特意冷冻保存的。
2. 培养时间：囊胚的培养时间相对较长，需要在体外培养5 - 7天。在这个过程中，胚胎需要适应体外培养环境，对培养条件要求较高。而冻胚的培养时间则取决于其冷冻前所处的发育阶段，如果是卵裂期胚胎冷冻，一般培养2 - 3天就进行冷冻；若是囊胚冷冻，则培养时间与囊胚培养时间相同。
3. 移植成功率：囊胚移植的成功率相对较高。因为囊胚经过了更充分的发育，更符合子宫的生理状态，与子宫内膜的同步性更好，着床能力更强。而冻胚移植成功率受到多种因素影响，如胚胎质量、冷冻和解冻过程对胚胎的损伤等。不过随着冷冻技术的不断进步，冻胚移植成功率也在逐渐提高。
4. 细胞数量与结构：囊胚的细胞数量较多，一般有上百个细胞，并且已经分化为内细胞团和滋养层细胞。内细胞团将来会发育成胎儿，滋养层细胞则会发育成胎盘。而冻胚如果是卵裂期胚胎，细胞数量相对较少，一般在8 - 16个细胞左右，细胞还未明显分化。
5. 保存方式：囊胚通常是在培养到合适阶段后，若不立即进行移植，也可进行冷冻保存。冻胚则是专门采用冷冻技术将胚胎保存起来，常见的冷冻方法有慢速冷冻法和玻璃化冷冻法。冷冻后的胚胎可以在合适的时机解冻后进行移植。
囊胚和冻胚在形成过程、培养时间、移植成功率、细胞数量与结构、保存方式等方面存在明显差异。了解这些差异有助于在辅助生殖技术中，根据患者的具体情况，选择更合适的胚胎进行移植，提高受孕的成功率。在进行相关治疗时，患者应与医生充分沟通，医生会综合多方面因素制定个性化的治疗方案。