怀孕45天出现褐色分泌物，可能是先兆流产、宫外孕、宫颈息肉、阴道炎、葡萄胎等疾病的信号。
1. 先兆流产：是较为常见的原因。在怀孕早期，胚胎着床还不稳定，可能因母体因素如内分泌失调、子宫异常，或外界因素如过度劳累、外伤等，导致子宫收缩，使妊娠组织与子宫壁分离，引起少量出血，血液在阴道内氧化后变成褐色分泌物排出。治疗上，可使用黄体酮胶囊、地屈孕酮片、烯丙雌醇片等药物进行保胎治疗，同时需要卧床休息，减少活动。
2. 宫外孕：指受精卵在子宫体腔以外着床，最常见的是输卵管妊娠。随着胚胎的生长，输卵管无法承受其发育，会导致局部破裂出血，血液积聚在盆腔内，少量经阴道流出就表现为褐色分泌物。宫外孕一旦确诊，通常需要根据具体情况采取药物治疗，如甲氨蝶呤，或者手术治疗。
3. 宫颈息肉：是慢性宫颈炎的一种表现，由于炎症刺激，宫颈黏膜局部增生并向宫颈外口突出形成息肉。怀孕后，随着体内激素水平的变化，息肉表面的血管可能破裂出血，血液混合在白带中形成褐色分泌物。一般在孕期可先观察，若出血较多或息肉较大，可在合适的孕周进行息肉摘除术。
4. 阴道炎：孕期女性身体抵抗力下降，阴道内环境改变，容易受到细菌、真菌等病原体的侵袭，引发阴道炎。炎症刺激阴道黏膜充血、水肿，可能出现少量出血，表现为褐色分泌物。治疗时，根据不同的病原体，可使用克霉唑栓、甲硝唑栓、制霉菌素栓等药物，但必须遵医嘱。
5. 葡萄胎：是一种异常的妊娠情况，胎盘绒毛滋养细胞增生，间质高度水肿，形成大小不一的水泡，形似葡萄。葡萄胎患者子宫内会有不规则出血，早期可能表现为褐色分泌物。一旦确诊葡萄胎，需要及时进行清宫手术。
怀孕45天出现褐色分泌物是一个需要引起重视的情况，可能预示着多种疾病。孕妇发现这种情况后，应及时到正规医院就诊，进行详细的检查，如超声检查、血HCG检查、妇科检查等，以明确病因，并在医生的指导下进行相应的治疗。