罕见病引发女生肚子疼危害大，早筛早治可控制病情。引发肚子疼的罕见病有子宫内膜异位症、克罗恩病、卟啉病、遗传性血管性水肿、腹型癫痫等。
1. 子宫内膜异位症：这是一种常见的妇科罕见病，指子宫内膜组织出现在子宫体以外的部位。异位的内膜会随着月经周期而出血，刺激周围组织，引起疼痛。疼痛部位多为下腹深部和腰骶部，可放射至会阴、肛门或大腿。其疼痛程度与病灶大小不一定成正比，部分患者可能有深部性交痛、不孕等表现。治疗药物有布洛芬、萘普生、孕三烯酮等，需遵医嘱使用。
2. 克罗恩病：是一种病因不明的胃肠道慢性炎性肉芽肿性疾病，可累及从口腔到肛门的整个消化道。病变呈节段性或跳跃式分布，好发于末端回肠和邻近结肠。患者主要表现为腹痛、腹泻、体重下降等，腹痛多位于右下腹或脐周，呈间歇性发作。治疗药物包括柳氮磺吡啶、美沙拉嗪、泼尼松等，具体用药应遵医嘱。
3. 卟啉病：是一组由于血红素合成途径中酶活性缺陷所引起的代谢性疾病。急性发作时，患者可出现剧烈的腹痛，疼痛部位不固定，可伴有恶心、呕吐、便秘等症状。还可能出现神经精神症状，如焦虑、抑郁、失眠等。治疗上可使用羟高铁血红素、氯丙嗪、葡萄糖等药物，使用时需遵循医嘱。
4. 遗传性血管性水肿：是一种常染色体显性遗传病，由于体内补体系统的某些成分缺乏或功能异常所致。患者可反复出现皮肤和黏膜下水肿，当累及胃肠道时，可引起腹痛、恶心、呕吐等症状。腹痛通常较为剧烈，呈绞痛样。治疗药物有达那唑、艾替班特、依库珠单抗等，要遵医嘱用药。
5. 腹型癫痫：是一种以发作性腹痛为主要表现的癫痫类型，多见于儿童和青少年。腹痛突然发作，多位于脐周或上腹部，疼痛程度不一，可伴有恶心、呕吐、腹泻等症状。发作持续时间较短，一般数分钟至数小时不等。治疗药物有卡马西平、丙戊酸钠、苯妥英钠等，具体用药需遵医嘱。
罕见病引发女生肚子疼的情况较为复杂，不同的罕见病有不同的症状和治疗方法。早筛早治对于控制病情、改善预后至关重要。当女生出现不明原因的肚子疼时，应及时到正规医院就诊，进行详细的检查，以明确病因，并采取相应的治疗措施。同时，患者在治疗过程中要严格遵医嘱用药，积极配合治疗。