胎儿亲子鉴定方法分为传统和现代两类。传统方法有绒毛取样法、羊水穿刺法；现代方法有无创胎儿亲子鉴定、母血中胎儿游离DNA检测、单核苷酸多态性分析技术等。
1. 绒毛取样法：属于传统胎儿亲子鉴定方法，一般在怀孕10 - 13周进行。是通过细针穿刺胎盘绒毛组织来获取样本，此方法能较早确定亲子关系，但存在一定风险，如可能导致流产、感染，还可能影响胎儿肢体发育。
2. 羊水穿刺法：通常在怀孕16 - 22周进行，医生在超声引导下将穿刺针经腹壁刺入羊膜腔抽取羊水，从中提取胎儿的细胞进行检测。不过该方法也有流产、感染等风险，对孕妇和胎儿有一定潜在危害。
3. 无创胎儿亲子鉴定：这是现代较为常用的方法，在怀孕5周以上即可进行。只需采集孕妇的外周血，利用新一代DNA测序技术对母体外周血浆中的游离DNA片段进行测序、生物信息分析，从中得到胎儿的遗传信息，再与假定父亲的DNA信息进行比对，就可以判断亲子关系。此方法无创，对孕妇和胎儿基本无伤害。
4. 母血中胎儿游离DNA检测：也是现代技术，通过先进的检测手段从母血中分离出胎儿游离DNA，进行基因分析。该方法检测时间早，准确性高，且避免了侵入性操作带来的风险。
5. 单核苷酸多态性分析技术：利用现代基因检测技术，检测胎儿和疑似父亲的单核苷酸多态性位点，进行比对分析来确定亲子关系。这种技术具有高灵敏度和准确性，能更精准地判断亲子关系。
传统的胎儿亲子鉴定方法如绒毛取样法和羊水穿刺法，虽然能在一定程度上确定亲子关系，但存在流产、感染等风险。而现代的胎儿亲子鉴定方法，如无创胎儿亲子鉴定、母血中胎儿游离DNA检测、单核苷酸多态性分析技术等，具有无创、检测时间早、准确性高等优点，能更好地保障孕妇和胎儿的安全。在选择胎儿亲子鉴定方法时，应根据怀孕时间、个人情况等因素综合考虑，并在专业医生的指导下进行。