晚上腿疼可能与基因相关的因素有维生素D受体基因、钙敏感受体基因、肌肉生长抑制素基因、疼痛相关基因、线粒体基因等。
1. 维生素D受体基因：该基因的某些变异会影响人体对维生素D的吸收和利用。维生素D对于钙的吸收和骨骼健康至关重要，当维生素D缺乏时，会导致血钙水平下降，引起腿部肌肉痉挛和疼痛。而且维生素D受体基因异常可能使机体不能有效利用维生素D，即便补充了足够的维生素D，也难以达到理想的效果，增加了晚上腿疼的几率。
2. 钙敏感受体基因：钙敏感受体在维持血钙平衡中起着关键作用。钙敏感受体基因发生突变，会使受体对血钙浓度的感知出现异常，进而影响甲状旁腺激素的分泌。甲状旁腺激素能调节血钙水平，其分泌异常会导致血钙波动，当血钙降低时，腿部肌肉兴奋性增加，容易引发疼痛。
3. 肌肉生长抑制素基因：此基因主要调控肌肉的生长和发育。若该基因出现变异，可能会使肌肉生长受到抑制，导致肌肉力量减弱、耐力下降。在白天活动后，腿部肌肉承受了一定的压力，由于基因影响导致肌肉恢复能力变差，晚上就容易出现疼痛症状。
4. 疼痛相关基因：人体存在一些与疼痛感知和调节相关的基因。这些基因的多态性会影响个体对疼痛的敏感性和耐受性。具有某些特定基因类型的人，可能对腿部的疼痛刺激更为敏感，即使是轻微的不适也会感觉疼痛明显，且在晚上安静的环境下，这种疼痛感觉可能会更加突出。
5. 线粒体基因：线粒体是细胞的能量工厂，线粒体基因异常会影响能量代谢。腿部肌肉在活动时需要大量能量供应，当线粒体功能因基因问题受损时，肌肉能量代谢障碍，乳酸等代谢产物堆积，就会引起腿部疼痛，尤其是在晚上休息时，代谢产物的刺激可能导致疼痛加剧。
针对晚上腿疼，治疗方法可遵医嘱使用碳酸钙、维生素D滴剂、布洛芬等药物。碳酸钙可补充钙质，缓解因缺钙引起的腿疼；维生素D滴剂有助于促进钙的吸收；布洛芬具有抗炎、止痛的作用，能减轻疼痛症状。若症状持续不缓解，建议到正规医院的骨外科|神经内科就诊。
晚上腿疼的基因奥秘涉及多个方面，维生素D受体基因、钙敏感受体基因、肌肉生长抑制素基因、疼痛相关基因和线粒体基因等都可能对其产生影响。了解这些基因因素，有助于更深入地认识晚上腿疼的病因，为预防和治疗提供新的思路。但基因因素只是一方面，还需结合其他因素综合判断和处理。