头发亲子鉴定准确率较高，其原理涉及到细胞核DNA提取、STR分型检测、基因位点比对、孟德尔遗传定律应用、排除基因突变影响等方面。
1. 细胞核DNA提取：头发的毛囊部位含有细胞核，其中包含着个体完整的遗传信息。在进行亲子鉴定时，首先要从头发毛囊中提取出细胞核DNA，这是后续分析的基础。通过特定的化学试剂和技术手段，将细胞核从细胞中分离出来，并进一步提取出其中的DNA。
2. STR分型检测：提取到的DNA会进行STR（短串联重复序列）分型检测。STR是基因组中短串联重复的DNA序列，不同个体的STR序列长度和重复次数存在差异。利用PCR（聚合酶链式反应）技术对特定的STR位点进行扩增，然后通过电泳等方法对扩增产物进行分析，确定每个STR位点的分型。
3. 基因位点比对：将被检测的头发样本与疑似父（母）的样本进行基因位点比对。一般会选择多个具有高度多态性的STR位点进行检测和比对。如果在多个位点上，孩子的基因分型能够与疑似父（母）的基因分型相匹配，就说明两者之间存在亲子关系的可能性较大。
4. 孟德尔遗传定律应用：亲子鉴定依据孟德尔遗传定律。孩子的基因一半来自父亲，一半来自母亲。在基因位点比对过程中，会根据这一规律来判断亲子关系。例如，在某个特定的STR位点上，孩子的一个等位基因必然来自父亲，另一个来自母亲。通过对多个位点的分析，可以更准确地判断亲子关系。
5. 排除基因突变影响：虽然基因突变的概率较低，但在亲子鉴定中也需要考虑到这种情况。当出现个别位点不匹配时，需要进一步分析是否是由于基因突变导致的。可以通过增加检测的位点数量或者采用其他检测方法来排除基因突变对结果的干扰，以确保鉴定结果的准确性。
头发亲子鉴定通过细胞核DNA提取、STR分型检测、基因位点比对、应用孟德尔遗传定律以及排除基因突变影响等步骤，能够较为准确地判断亲子关系。其准确率高达99%，为解决亲子关系纠纷等问题提供了科学可靠的依据。但在进行亲子鉴定时，仍需选择专业、正规的鉴定机构，以保证鉴定过程的规范性和结果的准确性。