肩关节疼痛可能隐藏的重大疾病有肩周炎、肩袖损伤、颈椎病、肱二头肌长头肌腱炎、肺癌等。
1. 肩周炎：又称“五十肩”“冻结肩”，是肩关节周围软组织不明原因自限性无菌性炎症。主要表现为肩部逐渐产生疼痛，夜间为甚，逐渐加重，肩关节活动功能受限而且日益加重，达到某种程度后逐渐缓解，直至最后完全复原。治疗上，可采用物理治疗如热敷、按摩等，药物治疗可选用布洛芬、双氯芬酸钠、美洛昔康等非甾体抗炎药，以缓解疼痛和炎症，同时需进行功能锻炼。
2. 肩袖损伤：是指肩袖肌腱的损伤，多因间接暴力、退行性变等引起。患者会感到肩部疼痛、无力，在上举或外展手臂时疼痛加剧。治疗时，损伤较轻者可通过休息、制动、物理治疗等保守治疗方法，药物可使用塞来昔布、依托考昔、萘普生等减轻疼痛；损伤严重者则可能需要手术治疗。
3. 颈椎病：颈椎发生病变后，可能会压迫神经根，导致肩部放射性疼痛。除肩部疼痛外，还可能伴有上肢麻木、无力、颈部疼痛等症状。治疗方法包括颈椎牵引、按摩、针灸等物理治疗，药物可选用甲钴胺、维生素B1、颈复康颗粒等营养神经、改善症状，病情严重时可能需手术治疗。
4. 肱二头肌长头肌腱炎：由于肱二头肌长头肌腱在肩关节活动时反复摩擦、劳损引起。主要症状为肩部前方疼痛，可向上臂放射，在屈肘和旋后时疼痛加重。治疗可采用休息、冰敷、物理治疗，药物可选用阿司匹林、吲哚美辛、氯诺昔康等，必要时可进行局部封闭治疗。
5. 肺癌：当肺癌发生在肺尖部时，可能会侵犯臂丛神经，导致肩部疼痛。这种疼痛通常较为顽固，且可能伴有咳嗽、咯血、胸痛、消瘦等症状。治疗需根据肺癌的分期、病理类型等选择手术、放疗、化疗、靶向治疗等综合治疗方法。
肩关节疼痛可能是多种重大疾病的表现，不能掉以轻心。当出现肩关节疼痛时，应及时就医，进行详细的检查，以明确病因，并采取相应的治疗措施。早期诊断和治疗对于改善病情、提高生活质量至关重要。