厌氧菌感染在临床较为常见，普通治疗与使用抗厌氧菌药物治疗在治疗针对性、治疗时间、治疗有效率、复发率、并发症发生率等方面存在显著差异。
1. 治疗针对性：普通治疗通常是采用广谱抗菌药物等进行经验性治疗，对厌氧菌的针对性不强。而抗厌氧菌药物是专门针对厌氧菌的特性研发的，能够精准作用于厌氧菌，破坏其细胞壁、抑制其代谢等，从而达到杀灭或抑制厌氧菌生长的目的。例如甲硝唑、替硝唑、奥硝唑等药物，对脆弱拟杆菌等常见厌氧菌有良好的抗菌活性。
2. 治疗时间：对于厌氧菌感染，普通治疗可能由于不能有效抑制或杀灭厌氧菌，导致感染控制缓慢，治疗时间延长。而使用抗厌氧菌药物治疗，能快速起效，缩短病程。有研究表明，在治疗牙周炎的厌氧菌感染时，使用抗厌氧菌药物治疗的患者平均治疗时间比普通治疗缩短了约 3 - 5 天。
3. 治疗有效率：普通治疗因缺乏对厌氧菌的特异性作用，有效率相对较低。使用抗厌氧菌药物治疗能显著提高治疗有效率。以盆腔厌氧菌感染为例，普通治疗的有效率可能在 60%左右，而使用抗厌氧菌药物联合治疗后，有效率可提升至 90%以上。
4. 复发率：普通治疗可能无法彻底清除厌氧菌，导致病情容易复发。抗厌氧菌药物能更有效地杀灭厌氧菌，降低复发风险。在治疗慢性阑尾炎的厌氧菌感染时，普通治疗后的复发率约为 20% - 30%，而使用抗厌氧菌药物规范治疗后，复发率可降至 5% - 10%。
5. 并发症发生率：若厌氧菌感染未得到及时有效的控制，可能引发一系列并发症。普通治疗效果不佳时，并发症发生的可能性增加。使用抗厌氧菌药物治疗能更好地控制感染，减少并发症的发生。如在肺部厌氧菌感染中，普通治疗时脓胸等并发症的发生率约为 15%，而使用抗厌氧菌药物治疗后，并发症发生率可降低至 5%以下。
综上所述，普通治疗和使用抗厌氧菌药物治疗在多个方面存在明显差异，使用抗厌氧菌药物治疗在治疗效果上具有显著优势。但具体的治疗方案应根据患者的病情、病原菌种类等因素综合考虑，且使用抗厌氧菌药物需遵医嘱。当出现厌氧菌感染相关症状时，建议及时到正规医院就诊。