奶粉喂养和母乳喂养在婴儿感染性疾病、过敏疾病、消化系统疾病这3大疾病风险上存在差异。母乳喂养可降低婴儿腹泻、呼吸道感染、中耳炎等感染性疾病风险，减少牛奶蛋白过敏、湿疹等过敏疾病发生，还能降低便秘、肠绞痛等消化系统疾病几率；而奶粉喂养在这些方面的疾病风险相对较高。
1. 感染性疾病：母乳中含有丰富的免疫球蛋白、乳铁蛋白、溶菌酶等免疫活性物质，这些物质可以帮助婴儿抵抗细菌、病毒等病原体的侵袭。例如免疫球蛋白能够识别并结合病原体，阻止其黏附在婴儿的呼吸道、消化道等黏膜表面，从而降低呼吸道感染、腹泻等疾病的发生风险。相比之下，奶粉中虽然也添加了一些营养成分，但免疫活性物质的含量远不及母乳，所以奶粉喂养的婴儿感染性疾病的发病几率相对较高。
2. 过敏疾病：母乳中的蛋白质是婴儿最容易消化和吸收的，而且母乳中的蛋白质结构与人体自身的蛋白质结构相似，不易引起过敏反应。而奶粉中的蛋白质主要是牛奶蛋白，对于一些肠道功能尚未发育完善的婴儿来说，牛奶蛋白可能会被视为外来的“异物”，从而引发免疫系统的过度反应，导致牛奶蛋白过敏、湿疹等过敏疾病。此外，母乳喂养还可以调节婴儿的肠道菌群，增强肠道屏障功能，进一步降低过敏的风险。
3. 消化系统疾病：母乳喂养时，母乳的成分和比例会随着婴儿的生长发育而自动调整，以满足婴儿不同阶段的营养需求。而且母乳中的脂肪球较小，含有丰富的乳糖和低聚糖，这些成分有助于促进婴儿肠道有益菌群的生长，维持肠道微生态平衡，预防便秘、肠绞痛等消化系统疾病。奶粉喂养时，由于奶粉的成分相对固定，可能无法完全适应婴儿的消化需求，而且奶粉中的蛋白质和脂肪颗粒较大，不易消化，容易导致婴儿出现消化不良、便秘等问题。
4. 口腔健康：母乳喂养过程中，婴儿的吸吮动作可以促进口腔肌肉的发育，有助于建立正确的口腔咬合关系。同时，母乳中的一些成分还具有抗菌作用，能够预防龋齿的发生。奶粉喂养时，如果奶瓶喂养姿势不当，可能会影响婴儿口腔的正常发育，增加龋齿的发生风险。
5. 长期健康影响：母乳喂养不仅对婴儿的近期健康有益，还可能对其长期健康产生积极影响。研究表明，母乳喂养的婴儿在成年后患肥胖、糖尿病、心血管疾病等慢性疾病的风险相对较低。而奶粉喂养可能与这些慢性疾病的发生存在一定的关联。
综上所述，母乳喂养在降低婴儿感染性疾病、过敏疾病和消化系统疾病等方面具有明显的优势。为了婴儿的健康成长，建议在条件允许的情况下尽量选择母乳喂养。如果因特殊原因无法进行母乳喂养，应选择适合婴儿年龄阶段的配方奶粉，并注意科学喂养。