宝宝拉肚子吃益生菌有诸多科学依据，包括调节肠道菌群平衡、增强肠道屏障功能、抑制有害菌生长、改善消化功能、调节免疫功能等。
1. 调节肠道菌群平衡：正常情况下，人体肠道内存在着多种微生物，它们相互制约、相互依存，形成一个动态的平衡。当宝宝拉肚子时，这种平衡被打破，有害菌数量增多。益生菌可以补充有益菌，帮助恢复肠道菌群的正常比例，维持肠道微生态的稳定。例如双歧杆菌、嗜酸乳杆菌等益生菌，能够在肠道内定植，与有害菌竞争生存空间和营养物质，从而抑制有害菌的过度繁殖。
2. 增强肠道屏障功能：肠道黏膜是人体抵御外界病原体的重要屏障。益生菌可以促进肠道黏膜细胞的生长和修复，增强肠道黏膜的屏障功能。它们能够刺激肠道黏膜分泌黏液，黏液可以包裹病原体，阻止其与肠道黏膜细胞接触，减少病原体的入侵。同时，益生菌还可以调节肠道黏膜的免疫反应，增强肠道的免疫防御能力。
3. 抑制有害菌生长：部分益生菌能够产生抗菌物质，如有机酸、细菌素等，这些物质可以抑制有害菌的生长和繁殖。例如，乳酸菌产生的乳酸可以降低肠道内的pH值，创造一个不利于有害菌生存的酸性环境，从而抑制大肠杆菌、沙门氏菌等有害菌的生长。
4. 改善消化功能：宝宝拉肚子时，消化功能往往会受到影响。益生菌可以分泌多种消化酶，如蛋白酶、脂肪酶、淀粉酶等，帮助分解食物，促进营养物质的消化和吸收。此外，益生菌还可以促进肠道蠕动，改善肠道的消化和排空功能，缓解拉肚子的症状。
5. 调节免疫功能：肠道是人体最大的免疫器官，益生菌可以调节肠道局部和全身的免疫功能。它们能够刺激肠道黏膜下的免疫细胞，如淋巴细胞、巨噬细胞等，增强免疫细胞的活性和功能，提高机体的免疫力。通过调节免疫功能，益生菌可以帮助宝宝更好地抵御病原体的感染，减少拉肚子的发生。
常用的益生菌药物有双歧杆菌四联活菌片、地衣芽孢杆菌活菌胶囊、枯草杆菌二联活菌颗粒等。但使用时需遵医嘱。
综上所述，宝宝拉肚子吃益生菌具有多方面的科学依据。益生菌通过调节肠道菌群平衡、增强肠道屏障功能、抑制有害菌生长、改善消化功能和调节免疫功能等作用，对缓解宝宝拉肚子的症状、促进肠道健康恢复具有积极意义。当宝宝出现拉肚子的情况时，可在医生的指导下合理使用益生菌。