12岁来月经与16岁来月经身高可能出现较大差异，主要与激素水平、骨骼发育时间、生长潜力、营养吸收、生活方式等因素有关。
1. 激素水平：月经初潮意味着体内雌激素等激素水平上升。12岁来月经，雌激素过早升高，会加速骨骼的生长板闭合。生长板是骨骼生长的关键部位，一旦闭合，骨骼就基本停止纵向生长。而16岁来月经，雌激素相对较晚发挥这种作用，骨骼有更长时间处于生长状态。
2. 骨骼发育时间：12岁来月经时，骨骼发育进程相对提前。在这个阶段，骨骼虽然会快速生长，但也会提前结束生长周期。相比之下，16岁来月经，骨骼发育启动较晚，生长周期延长，有更多时间来增加骨长度，从而使身高有更大的增长空间。
3. 生长潜力：一般来说，月经初潮后身高增长速度会逐渐减慢。12岁来月经，后续的生长潜力相对较小，因为大部分的生长时间已经在初潮前消耗。而16岁来月经，在初潮前还有较多的生长时间可以挖掘，身高增长的潜力更大。
4. 营养吸收：青春期是身体快速发育的时期，需要充足的营养支持。12岁来月经的女孩，由于生长发育提前，对营养的需求也提前增加。如果此时营养供应不足，会影响身高增长。而16岁来月经的女孩，可能在营养储备和吸收方面更有优势，更有利于身高的增长。
5. 生活方式：12岁的女孩可能还没有形成良好的生活习惯，如睡眠不足、缺乏运动等，这些因素会影响生长激素的分泌，进而影响身高。16岁的女孩相对更懂事，可能会更注重生活方式的调整，保证充足的睡眠和适当的运动，有利于身高的增长。
综上所述，12岁来月经与16岁来月经在激素水平、骨骼发育时间、生长潜力、营养吸收和生活方式等方面存在差异，这些差异可能导致两者身高出现10厘米左右的差距。但这并不是绝对的，身高还受到遗传等多种因素的影响。如果对孩子的身高发育有疑虑，建议及时到正规医院的儿科或内分泌科就诊。