三周岁男孩身高体重不达标，可能由营养摄入不足、睡眠质量不佳、缺乏运动、疾病因素、遗传因素等导致。
1. 营养摄入不足：三周岁男孩正处于生长发育的重要阶段，需要充足且均衡的营养。如果日常饮食中蛋白质、钙、维生素等营养素缺乏，会影响骨骼生长和身体发育，进而导致身高体重不达标。比如蛋白质是身体细胞的重要组成部分，缺乏蛋白质会影响身体的正常代谢和生长；钙是骨骼发育的关键元素，钙摄入不足会影响骨骼的生长和强度。
2. 睡眠质量不佳：生长激素在夜间睡眠时分泌旺盛，尤其是深度睡眠阶段。若三周岁男孩睡眠不足或睡眠质量差，会影响生长激素的分泌，从而对身高体重的增长产生不利影响。例如，睡眠环境嘈杂、作息不规律等都可能导致睡眠质量下降。
3. 缺乏运动：适当的运动可以刺激骨骼生长板，促进骨骼生长，还能增强食欲，有助于营养的吸收。三周岁男孩如果长期缺乏运动，身体的新陈代谢减缓，肌肉得不到有效锻炼，会影响身体的正常发育，导致身高体重不达标。像跑步、跳跃、攀爬等运动都对身体发育有益。
4. 疾病因素：一些疾病会影响孩子的生长发育。比如消化系统疾病，会影响营养的消化和吸收；内分泌疾病，如甲状腺功能减退症，会导致甲状腺激素分泌不足，影响身体的代谢和生长；慢性感染性疾病，会消耗身体的能量和营养，阻碍身高体重的增长。
5. 遗传因素：遗传在孩子的身高体重方面起着重要作用。如果父母身高较矮或体重偏低，孩子受到遗传基因的影响，可能出现身高体重不达标。不过，遗传因素并非唯一决定因素，通过后天的努力，仍可在一定程度上改善孩子的生长发育状况。
针对这些情况，若怀疑是营养问题，可在医生指导下补充碳酸钙、维生素D、葡萄糖酸锌等药物；若因疾病导致，需及时就医，针对具体疾病进行治疗。但所有药物使用都应遵医嘱。
三周岁男孩身高体重不达标是一个需要家长重视的问题，可能由多种因素引起。家长应关注孩子的饮食、睡眠、运动等方面，若发现异常，及时带孩子到正规医院就诊，以便查明原因并采取相应的措施，促进孩子健康成长。