12岁男孩身高不达标，可能由遗传因素、营养缺乏、生长激素缺乏、睡眠不足、疾病影响等导致。

1. 遗传因素：遗传在孩子身高方面起着重要作用。若父母身高较矮，孩子受遗传基因影响，身高可能相对同龄人不占优势。不过，遗传并非决定身高的唯一因素，后天的干预仍可在一定程度上改善身高情况。

2. 营养缺乏：12岁男孩正处于生长发育的关键时期，对营养的需求较大。如果日常饮食中蛋白质、钙、维生素D等营养素摄入不足，会影响骨骼的生长和发育。例如，蛋白质是身体细胞的重要组成部分，缺乏蛋白质会导致生长缓慢；钙是骨骼的主要成分，钙摄入不足会影响骨骼的硬度和生长速度。

3. 生长激素缺乏：生长激素是促进骨骼生长和身体发育的重要激素。若孩子脑垂体分泌的生长激素不足，会直接影响身高增长。生长激素缺乏可能是先天性的，也可能由后天的疾病、损伤等因素引起。

4. 睡眠不足：生长激素在夜间睡眠时分泌旺盛，尤其是深度睡眠阶段。如果12岁男孩长期睡眠不足，会影响生长激素的正常分泌，从而对身高增长产生不利影响。此外，睡眠不足还会影响孩子的身体免疫力和精神状态。

5. 疾病影响：一些疾病，如甲状腺功能减退症、慢性疾病等，会影响孩子的生长发育。甲状腺功能减退症会导致甲状腺激素分泌不足，影响新陈代谢和生长发育；慢性疾病如慢性肾病、先天性心脏病等，会消耗身体的能量和营养，影响孩子的正常生长。

综上所述，12岁男孩身高不达标受多种因素影响。针对不同原因，可采取相应措施。如保证营养均衡，多摄入富含蛋白质、钙和维生素D的食物，像牛奶、鸡蛋、鱼肉等；保证充足睡眠，养成良好的作息习惯；若怀疑生长激素缺乏或有其他疾病，应及时到正规医院就诊检查。必要时，可在医生指导下使用重组人生长激素、维生素D、碳酸钙等药物进行治疗，但需严格遵医嘱。

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