月经结束第三天同房怀孕几率受月经周期、经期时长、排卵情况、精子存活时间、个体差异等因素影响。

1. 月经周期：月经周期长短不同，会使排卵期出现变化。若月经周期较短，如21 - 25天，月经结束第三天可能接近排卵期，此时同房，怀孕几率相对较大；而月经周期较长，如35天左右，怀孕几率则相对较小。

2. 经期时长：经期持续时间长短也会影响怀孕几率。若经期较长，比如持续7 - 8天，月经结束第三天就更靠近排卵期，精子有可能在女性体内存活等待卵子排出，从而增加怀孕可能性；若经期较短，仅持续3 - 4天，怀孕几率会降低。

3. 排卵情况：正常情况下女性每月排卵一次，但排卵会受到多种因素干扰，如情绪波动、环境变化、疾病等。可能会出现额外排卵或排卵提前、推迟的情况。若在月经结束第三天出现额外排卵，此时同房就会大大增加怀孕几率。

4. 精子存活时间：精子在女性生殖道内具有一定存活时间，一般为2 - 3天，个别情况下可存活5 - 7天。若精子在月经结束第三天进入女性体内，且女性在之后的几天内排卵，精子就有机会与卵子结合，导致怀孕。

5. 个体差异：不同女性的身体状况存在差异，内分泌水平、生殖系统功能等各不相同。有些女性生殖系统功能较为活跃，即使在看似安全期的月经结束第三天，也可能有较高的怀孕几率；而有些女性身体状况特殊，怀孕几率则相对较低。

综上所述，月经结束第三天同房怀孕几率不能一概而论，会受到月经周期、经期时长、排卵情况、精子存活时间和个体差异等多种因素影响。若暂无生育计划，即使在该时期同房，也建议采取有效的避孕措施，以避免意外怀孕。若对怀孕相关问题有疑虑，可到正规医院妇产科或生殖健康科咨询专业医生。

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