肉芽肿的形成病因多样，主要包括感染因素、自身免疫因素、异物刺激、遗传因素、环境因素等。
1. 感染因素：细菌、真菌、病毒等病原体感染均可引发肉芽肿。如结核分枝杆菌感染可导致结核性肉芽肿，这是由于机体对结核菌的免疫反应，形成以上皮样细胞、朗汉斯巨细胞为主要成分的结节状病灶。梅毒螺旋体感染可引起梅毒肉芽肿。此外，真菌如组织胞浆菌、隐球菌等感染也可能造成肺部、脑部等部位出现肉芽肿病变。
2. 自身免疫因素：当免疫系统出现异常，将自身组织误认作外来抗原进行攻击时，可引发肉芽肿性炎症。例如结节病，这是一种原因不明的多系统肉芽肿性疾病，患者的免疫系统紊乱，在肺部、淋巴结、皮肤等多个器官形成非干酪样坏死性肉芽肿。韦格纳肉芽肿，是一种坏死性肉芽肿性血管炎，主要侵犯小动脉、静脉及毛细血管，与自身抗体攻击血管内皮细胞有关。
3. 异物刺激：手术缝线、石棉纤维、滑石粉等异物进入人体后，机体的免疫系统会对其进行包裹和隔离，从而形成肉芽肿。如在外科手术后，部分患者对手术缝线产生异物反应，在切口处形成肉芽肿。长期吸入石棉纤维可导致肺部出现石棉肺伴发的肉芽肿病变。
4. 遗传因素：某些遗传性疾病与肉芽肿的发生密切相关。如慢性肉芽肿病，是一种由于基因缺陷导致吞噬细胞功能异常的遗传性疾病，患者的吞噬细胞无法有效杀灭细菌和真菌，容易反复发生感染，进而形成肉芽肿。家族性地中海热，是一种常染色体隐性遗传病，患者会出现周期性发热和浆膜炎，可在浆膜表面形成肉芽肿。
5. 环境因素：长期暴露在某些特定环境中，也可能增加肉芽肿的发病风险。例如长期接触化学物质如苯、甲醛等，可能损伤机体组织，诱发免疫反应，导致肉芽肿形成。空气污染严重的地区，空气中的有害物质如粉尘、烟雾等，可能刺激呼吸道黏膜，引发肺部肉芽肿病变。
肉芽肿的病因复杂多样，感染、自身免疫、异物刺激、遗传和环境等因素都可能参与其中。了解这些病因有助于早期预防和诊断肉芽肿性疾病。如果发现身体出现异常结节或不适症状，应及时前往正规医院就诊，以便明确病因并采取相应的治疗措施。治疗时需根据具体病因遵医嘱选择合适的药物，如抗结核药异烟肼、利福平、吡嗪酰胺等，免疫抑制剂环磷酰胺、硫唑嘌呤、甲氨蝶呤等。