情绪低落长期不好转，MR检查通常难以直接发现心理根源。这是因为心理根源多涉及认知、情感、社会环境等因素，而MR检查主要针对脑部结构和生理病变，存在局限性、心理问题本质复杂、受心理社会因素影响大、存在个体差异、需结合其他评估方法等情况。
1. MR检查的局限性：MR检查，即磁共振成像检查，主要是利用原子核磁共振现象，对人体各器官的形态、结构进行成像，以发现脑部是否存在器质性病变，如脑肿瘤、脑梗死、脑出血等。但心理问题大多并没有明显的脑部结构改变，所以很难通过MR检查直接找到心理根源。
2. 心理问题本质复杂：心理问题往往是由多种因素共同作用导致的，包括遗传因素、早期经历、性格特点、认知模式等。这些因素更多地涉及心理和社会层面，而非单纯的生理结构异常，因此MR检查无法全面评估这些因素。
3. 受心理社会因素影响大：情绪低落可能与生活中的重大事件、人际关系、工作压力等心理社会因素密切相关。这些因素无法通过MR检查检测出来，需要通过详细的问诊、心理测评等方式来了解。
4. 存在个体差异：不同的人对相同的心理社会因素可能有不同的反应，即使脑部存在一些细微的变化，也不能直接认定为心理问题的根源。而且，每个人的心理状态和应对方式都是独特的，不能单纯依靠影像学检查来判断。
5. 需结合其他评估方法：要明确情绪低落的心理根源，需要综合运用多种评估方法，如临床访谈、心理量表测评、行为观察等。这些方法可以从不同角度了解患者的心理状态、思维模式和情感体验，从而更准确地找出问题所在。
综上所述，情绪低落长期不好转时，MR检查一般不能直接发现心理根源。虽然MR检查在发现脑部器质性病变方面有重要作用，但对于心理问题的评估，还需要结合专业的心理评估方法。如果出现情绪低落长期不好转的情况，建议及时到正规医院的心理咨询科或精神心理科就诊，进行全面的评估和诊断。