某些罕见病可以尝试用益生菌辅助治疗，如苯丙酮尿症、短肠综合征、先天性乳糖不耐受症、多发性硬化症等。
1. 苯丙酮尿症：这是一种常见的氨基酸代谢病，由于肝脏中苯丙氨酸羟化酶缺乏或活性减低，使得苯丙氨酸不能正常转化为酪氨酸，导致苯丙氨酸及其酮酸蓄积，并从尿中大量排出。患者通常会出现智力发育迟缓、皮肤毛发色素浅淡等症状。益生菌可以调节肠道菌群，改善肠道屏障功能，减少肠道内苯丙氨酸的吸收。相关研究表明，部分益生菌能够参与苯丙氨酸的代谢过程，辅助降低血液中苯丙氨酸的水平。常用的益生菌有双歧杆菌四联活菌片、酪酸梭菌活菌散、地衣芽孢杆菌活菌胶囊等。
2. 短肠综合征：是由于各种原因导致小肠广泛切除后，小肠消化、吸收面积显著减少，引起的一系列临床综合征，患者会出现腹泻、营养不良等症状。益生菌有助于恢复肠道微生态平衡，促进肠道黏膜的修复和再生，增强肠道的消化和吸收功能。它可以抑制有害菌的生长，减少肠道感染的风险，同时还能产生一些有益的代谢产物，如短链脂肪酸等，为肠道细胞提供能量。在治疗短肠综合征时，可选用的益生菌有布拉氏酵母菌散、嗜酸乳杆菌片、凝结芽孢杆菌活菌片等。
3. 先天性乳糖不耐受症：因先天性乳糖酶缺乏，不能完全消化分解母乳或牛乳中的乳糖所引起的非感染性腹泻。患者进食含乳糖的食物后会出现腹胀、腹泻、腹痛等症状。益生菌可以在肠道内产生乳糖酶，帮助消化乳糖，减轻乳糖不耐受的症状。此外，益生菌还能改善肠道的免疫功能，增强肠道对乳糖的耐受性。常用的治疗该疾病的益生菌有双歧杆菌乳杆菌三联活菌片、枯草杆菌二联活菌颗粒、复合乳酸菌胶囊等。
4. 多发性硬化症：是一种中枢神经系统脱髓鞘疾病，其发病机制与自身免疫反应有关。肠道菌群失调在多发性硬化症的发病过程中可能起到一定作用。益生菌可以调节肠道菌群，影响免疫系统的功能，减少炎症反应，从而对多发性硬化症起到一定的辅助治疗作用。研究发现，某些益生菌能够调节T细胞的分化和功能，降低促炎细胞因子的水平。可使用的益生菌包括鼠李糖乳杆菌、长双歧杆菌、植物乳杆菌等制成的制剂。
5. 注意事项：在使用益生菌辅助治疗这些罕见病时，一定要遵医嘱。不同的患者病情和身体状况不同，需要根据具体情况选择合适的益生菌种类和使用方案。同时，益生菌不能替代正规的治疗方法，只是起到辅助治疗的作用。患者还需要定期到正规医院进行复查，以便及时调整治疗方案。
综上所述，苯丙酮尿症、短肠综合征、先天性乳糖不耐受症、多发性硬化症等罕见病或许可以使用益生菌进行辅助治疗。益生菌通过调节肠道菌群、改善肠道功能、影响免疫系统等途径，对这些疾病的治疗起到一定的积极作用。但在使用过程中需严格遵循医嘱，配合正规治疗，以达到更好的治疗效果。