空气水质差可能会加重肩膀上凸起骨头疼，主要与炎症反应加剧、营养物质缺乏、免疫功能下降、关节损伤修复受影响、心理压力增加等因素有关。
1. 炎症反应加剧：空气质量差时，空气中的污染物如二氧化硫、氮氧化物、颗粒物等可进入人体，引发呼吸道及全身的炎症反应。水质差可能含有细菌、病毒、重金属等有害物质，进入人体后也会导致炎症。而肩膀上凸起骨头处若本身存在炎症，如肩周炎、关节炎等，这些额外的炎症刺激会使局部炎症反应加剧，从而加重疼痛。
2. 营养物质缺乏：水质差可能导致水中的矿物质等营养成分含量异常或缺乏。例如，钙、镁等矿物质对骨骼健康至关重要。长期饮用这样的水，可能会影响骨骼的正常代谢和结构，使肩膀骨头的强度和韧性下降，进而加重疼痛。同时，空气污染可能影响植物的生长和质量，间接影响食物的营养成分，导致人体摄入的营养不均衡，不利于骨骼健康。
3. 免疫功能下降：空气和水质中的有害物质会对人体免疫系统造成损害。免疫系统功能降低后，人体抵御疾病的能力减弱，肩膀部位的原有疾病如骨膜炎等更易发作或加重。而且，免疫系统无法及时有效地清除局部的炎症因子和病原体，使得疼痛症状持续存在或加剧。
4. 关节损伤修复受影响：肩膀上凸起骨头处若有轻微损伤，良好的环境有利于损伤的修复。但空气水质差会干扰身体的正常修复机制。例如，有害物质可能影响细胞的代谢和增殖，使受损的骨骼和软组织修复缓慢，疼痛难以缓解，甚至可能导致损伤进一步加重。
5. 心理压力增加：长期处于空气水质差的环境中，人们可能会产生焦虑、烦躁等不良情绪。心理压力的增加会影响神经系统的调节功能，使痛觉敏感性提高。即使肩膀骨头的实际病变程度没有改变，但患者主观上会感觉疼痛更加明显。
综上所述，空气水质差在多种因素的作用下，是有可能加重肩膀上凸起骨头疼的。当出现这种情况时，应改善生活环境，同时及时到正规医院的骨外科或疼痛专科就诊，以明确病因并进行针对性治疗。可遵医嘱使用布洛芬、双氯芬酸钠、塞来昔布等药物缓解疼痛。