儿童晨起咳嗽可能是正常现象，也可能是疾病信号，常见因素有空气刺激、呼吸道感染、过敏、鼻后滴漏综合征、咳嗽变异性哮喘等。
1. 空气刺激：夜间睡眠时，室内空气可能较为干燥、污浊，晨起时儿童呼吸道受到冷空气或灰尘、烟雾等刺激，会引起短暂咳嗽。这是身体的一种保护性反射，一般咳嗽几声后会自行缓解，属于正常现象。通常保持室内空气清新、湿润，咳嗽情况会有所改善。
2. 呼吸道感染：病毒、细菌等病原体入侵呼吸道引发感染，如感冒、支气管炎等。炎症刺激呼吸道黏膜，导致分泌物增多，晨起时体位改变，痰液移动刺激咽喉，引起咳嗽。治疗上，若为病毒感染，可使用利巴韦林、阿昔洛韦、更昔洛韦等抗病毒药物；若为细菌感染，可选用阿莫西林、头孢克洛、阿奇霉素等抗生素，需遵医嘱用药。
3. 过敏：儿童接触到尘螨、花粉、动物毛发等过敏原，可引发过敏反应，导致呼吸道黏膜充血、水肿，出现咳嗽症状。晨起时，儿童可能接触到床上的尘螨等过敏原，从而诱发咳嗽。治疗可使用氯雷他定、西替利嗪、孟鲁司特钠等抗过敏药物，同时要尽量避免接触过敏原。
4. 鼻后滴漏综合征：患有鼻炎、鼻窦炎等鼻部疾病时，鼻腔分泌物增多，夜间睡眠时分泌物向后倒流至咽喉部，刺激咽喉引起咳嗽。治疗需针对鼻部疾病，可使用生理盐水冲洗鼻腔，减轻炎症，还可使用布地奈德鼻喷雾剂、糠酸莫米松鼻喷雾剂等鼻用糖皮质激素，以及桉柠蒎肠溶软胶囊等促进分泌物排出的药物，具体用药遵医嘱。
5. 咳嗽变异性哮喘：这是一种特殊类型的哮喘，以咳嗽为主要症状，多在夜间或晨起发作。其发病机制与气道高反应性有关，接触过敏原、冷空气等诱因后，气道收缩、痉挛，引发咳嗽。治疗通常使用吸入性糖皮质激素，如布地奈德福莫特罗粉吸入剂、沙美特罗替卡松粉吸入剂等，以及白三烯调节剂如孟鲁司特钠等，用药需遵循医生指导。
儿童晨起咳嗽可能是正常的生理反应，也可能是疾病的表现。当咳嗽持续不缓解、伴有发热、呼吸急促、喘息等其他症状时，应及时带儿童到正规医院就诊，明确病因，并在医生的指导下进行治疗。家长平时要注意保持室内空气良好，避免儿童接触过敏原和刺激性物质，以减少咳嗽的发生。