影响12周岁女孩身高体重的5种疾病，分别是生长激素缺乏症、甲状腺功能减退症、性早熟、营养不良症、先天性心脏病等。
1. 生长激素缺乏症：这是由于腺垂体合成和分泌生长激素部分或完全缺乏，或由于结构异常、受体缺陷等所致的生长发育障碍性疾病。生长激素能促进骨骼、内脏和全身生长，若缺乏会导致身高增长缓慢，身材矮小。治疗上，可使用重组人生长激素等药物进行替代治疗，需遵医嘱使用。
2. 甲状腺功能减退症：因甲状腺激素合成及分泌减少，或其生理效应不足所致机体代谢降低。甲状腺激素对生长发育，尤其是骨骼和神经系统的发育至关重要。缺乏时会出现代谢减慢、生长迟缓等症状。治疗药物有左甲状腺素钠等，治疗期间要定期复查甲状腺功能。
3. 性早熟：女孩在8岁前出现第二性征发育或10岁前月经来潮。性早熟会使骨骼提前闭合，影响最终身高。可能由下丘脑 - 垂体 - 性腺轴功能提前启动等原因引起。治疗药物有曲普瑞林、亮丙瑞林等，可延缓性发育进程。
4. 营养不良症：因能量和（或）蛋白质摄入不足或吸收障碍等引起。会导致身体无法获得足够营养来支持生长发育，出现体重不增甚至下降、身高增长缓慢等情况。可通过调整饮食结构，补充维生素、矿物质等营养元素，严重时可使用复方氨基酸、脂肪乳等药物进行营养支持。
5. 先天性心脏病：是胎儿期心脏及大血管发育异常所致的先天性畸形。心脏功能异常会影响身体的血液循环和氧气供应，导致身体各器官功能受到影响，从而影响生长发育。部分患者可通过手术治疗纠正心脏畸形，改善心脏功能。
12周岁女孩正处于生长发育的关键时期，生长激素缺乏症、甲状腺功能减退症、性早熟、营养不良症、先天性心脏病等疾病都可能对其身高体重产生不良影响。家长应密切关注女孩的生长发育情况，若发现异常，应及时带其到正规医院就诊，以便早诊断、早治疗。