咳嗽时小肚子疼的病因主要有腹部肌肉拉伤、膈肌痉挛、腹腔炎症、肠道问题、泌尿系统结石等。
1. 腹部肌肉拉伤：咳嗽时腹部肌肉会剧烈收缩，如果频繁且剧烈咳嗽，可能导致腹部肌肉拉伤，从而引起小肚子疼。一般在咳嗽动作发生时疼痛加剧，休息时疼痛会有所缓解。治疗上可采用热敷，促进局部血液循环，缓解疼痛，也可遵医嘱使用布洛芬、双氯芬酸钠、对乙酰氨基酚等药物减轻疼痛。
2. 膈肌痉挛：咳嗽过程中可能刺激到膈肌，引发膈肌痉挛。膈肌位于胸腔和腹腔之间，痉挛时会导致小肚子出现牵涉痛。可以尝试深呼吸、屏气等方法缓解膈肌痉挛，若症状严重，可遵医嘱使用山莨菪碱、东莨菪碱、颠茄片等药物解除痉挛。
3. 腹腔炎症：如盆腔炎、腹膜炎等腹腔炎症，本身腹腔内就存在炎症刺激，咳嗽时腹腔压力增大，会使炎症部位受到进一步刺激，导致小肚子疼。需要根据具体炎症类型进行治疗，一般可遵医嘱使用头孢克肟、左氧氟沙星、甲硝唑等抗生素进行抗感染治疗。
4. 肠道问题：肠道易激综合征、肠炎等肠道疾病，在咳嗽时由于腹压变化，可能诱发或加重肠道的不适，引起小肚子疼。对于肠道易激综合征，可遵医嘱使用匹维溴铵、曲美布汀、复方枸橼酸阿尔维林软胶囊等药物调节肠道功能；肠炎若为细菌感染，可遵医嘱使用诺氟沙星、环丙沙星、黄连素等药物治疗。
5. 泌尿系统结石：输尿管结石等泌尿系统结石，在咳嗽引起腹压改变时，结石可能移动，刺激输尿管等部位，导致小肚子疼，疼痛通常较为剧烈，还可能伴有血尿等症状。较小的结石可通过多喝水、多运动促进排出，也可遵医嘱使用排石颗粒、肾石通颗粒、金钱草颗粒等药物辅助排石；较大的结石可能需要体外冲击波碎石或手术治疗。
咳嗽时小肚子疼可能由多种原因引起，若症状持续不缓解或加重，应及时到正规医院就诊，通过详细检查明确病因，并在医生的指导下进行针对性治疗。同时，在治疗过程中，要严格遵医嘱用药。