月经总流不干净可能由内分泌失调、子宫肌瘤、子宫内膜炎、子宫内膜息肉、血液系统疾病等因素引起。
1. 内分泌失调：人体内分泌系统分泌的激素可调节月经周期和月经量。当内分泌失调时，如雌激素、孕激素水平失衡，会导致子宫内膜不能正常修复和脱落，从而使月经持续时间延长，出现月经总流不干净的情况。治疗上可使用戊酸雌二醇、黄体酮、地屈孕酮等药物调节激素水平，但需遵医嘱。
2. 子宫肌瘤：是女性生殖器最常见的良性肿瘤，由平滑肌及结缔组织组成。肌瘤可使子宫腔增大，子宫内膜面积增加并影响子宫收缩，此外肌瘤可能使肿瘤附近的静脉受挤压，导致子宫内膜静脉丛充血与扩张，从而引起经量增多、经期延长。对于较小的肌瘤，可使用促性腺激素释放激素类似物、米非司酮等药物治疗；若肌瘤较大或症状严重，则可能需要手术治疗。
3. 子宫内膜炎：细菌突破宫颈的防御侵入子宫内膜而发生炎症。炎症会使子宫内膜充血、水肿，严重者内膜表面可有脓性渗出物，从而影响子宫内膜的正常修复和剥脱，导致月经淋漓不尽。治疗通常采用抗生素，如头孢曲松钠、甲硝唑、阿奇霉素等，具体用药需遵医嘱。
4. 子宫内膜息肉：是子宫局部内膜过度生长所致，由子宫内膜腺体、间质和血管组成。息肉会影响子宫的正常收缩和内膜的修复，导致月经周期紊乱、经期延长等症状。较小的息肉可先观察，部分可自行消失；较大或有症状的息肉，通常需要手术切除。
5. 血液系统疾病：如血小板减少性紫癜、再生障碍性贫血、白血病等，会影响人体的凝血功能。当凝血功能出现异常时，月经期间子宫内膜脱落出血后难以正常止血，就会导致月经总流不干净。治疗需针对具体的血液系统疾病进行，可能包括使用糖皮质激素、免疫抑制剂、化疗药物等，应在医生的指导下进行。
月经总流不干净是一种需要引起重视的症状，可能隐藏着多种健康隐患。如果出现这种情况，应及时到正规医院的妇产科就诊，进行相关检查，如妇科超声、性激素六项、血常规等，以明确病因，并采取相应的治疗措施。早期诊断和治疗有助于避免病情加重，保障女性的生殖健康。