头孢克肟的副作用包括胃肠道反应、过敏反应、血液系统异常、肝肾功能损害、菌群失调等。
1. 胃肠道反应：较为常见，可能出现腹泻、恶心、呕吐、腹痛、消化不良等症状。这是因为头孢克肟在抑制或杀灭细菌的过程中，会对胃肠道的正常菌群产生一定影响，打乱胃肠道内的微生态平衡，进而影响胃肠道的正常消化和吸收功能。
2. 过敏反应：部分人使用头孢克肟后可能出现皮疹、瘙痒、红斑等皮肤过敏症状，严重时可能发生过敏性休克。过敏反应的发生是由于人体免疫系统将头孢克肟识别为外来的有害物质，从而启动免疫应答，释放出如组胺等物质，导致一系列过敏症状的出现。
3. 血液系统异常：可能会引起白细胞减少、血小板减少、嗜酸性粒细胞增多等情况。头孢克肟可能影响骨髓的造血功能，导致血细胞的生成、破坏或分布出现异常，从而影响血液系统的正常功能。
4. 肝肾功能损害：长期或大剂量使用头孢克肟可能会对肝脏和肾脏造成一定损害，导致肝功能指标如谷丙转氨酶、谷草转氨酶升高，肾功能指标如血肌酐、尿素氮升高等。药物在体内代谢过程中，需要经过肝脏的解毒和肾脏的排泄，这可能增加肝肾的负担，进而影响其正常功能。
5. 菌群失调：头孢克肟在杀灭病原菌的同时，也会抑制或杀灭一些有益的菌群，导致体内菌群失调。可能引发二重感染，如真菌性口腔炎、阴道炎等。正常情况下，人体各部位的菌群处于一种相对平衡的状态，当这种平衡被打破时，一些原本受到抑制的病菌就可能大量繁殖，引发新的感染。
6. 其他副作用：还可能出现头痛、头晕、乏力等神经系统症状，以及味觉异常、耳鸣等。这些副作用的发生机制较为复杂，可能与药物对神经系统的直接作用或间接影响有关。
头孢克肟在治疗感染性疾病方面有较好的疗效，但也可能带来多种副作用。在使用头孢克肟时，需要密切关注身体的反应，一旦出现不适症状，应及时告知医生。医生会根据具体情况判断是否需要调整用药方案。同时，使用头孢克肟必须严格遵医嘱，避免自行用药或滥用药物。