9岁男童一提上学就发烧近40℃，可能是心理因素、感染性疾病、免疫性疾病、血液系统疾病、内分泌疾病等导致的。

1. 心理因素：孩子可能因对上学存在过度的紧张、焦虑、恐惧等情绪，导致植物神经功能紊乱，从而引起发烧。这种情况称为心因性发热。

2. 感染性疾病：常见的如呼吸道感染，包括感冒、肺炎等；消化道感染，像肠胃炎；泌尿系统感染等。病原体可以是细菌、病毒、支原体等。

3. 免疫性疾病：例如幼年特发性关节炎、系统性红斑狼疮等。这类疾病会导致免疫系统异常活跃，产生炎症反应，引起发热。

4. 血液系统疾病：比如白血病，其会影响正常的造血功能，导致身体抵抗力下降，容易感染和发热。

5. 内分泌疾病：甲状腺功能亢进时，身体代谢加快，产热增加，可能出现发热。

总之，9岁男童一提上学就发烧近40℃的原因较为复杂。家长应及时带孩子到正规医院就诊，进行全面的检查，如血常规、C反应蛋白、免疫指标、甲状腺功能等，以明确病因，并采取相应的治疗措施。

（责编：家医在线 ）