食物不耐受症的确诊通常需要综合多种检查方法，包括血液检查、粪便检查、皮肤点刺试验、激发试验、食物排除和再引入试验等。

1. 血液检查：通过检测血液中特异性抗体的水平，如免疫球蛋白 G（IgG）抗体，来判断对某些食物的不耐受情况。常见检测的食物包括牛奶、鸡蛋、小麦、大豆等。

2. 粪便检查：分析粪便中的成分，如未消化的食物颗粒、肠道菌群的变化等，有助于了解食物在肠道内的消化吸收情况。

3. 皮肤点刺试验：将可能导致不耐受的食物提取物滴在皮肤上，用细针轻轻刺入皮肤表层，观察是否出现红肿、瘙痒等过敏反应。但该方法对于食物不耐受的诊断准确性相对较低。

4. 激发试验：在医生的密切监测下，逐渐引入可疑的不耐受食物，观察身体的反应，如胃肠道症状、皮肤症状等。但这种试验存在一定风险，需要谨慎进行。

5. 食物排除和再引入试验：先排除可能导致不耐受的食物一段时间，观察症状是否改善。然后再逐步重新引入这些食物，观察症状是否再次出现。

总之，食物不耐受症的诊断需要综合考虑患者的症状、病史以及上述多种检查结果。不同的检查方法各有优缺点，医生会根据具体情况选择合适的检查方式，以准确诊断食物不耐受症，并为后续的治疗和饮食调整提供依据。

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