肩胛骨囊肿一般是不会自愈的。若患者发现肩胛骨部位有明显的不适症状，要及时前往医院就医，按照病情的严重程度给予针对性的处理。
肩胛骨囊肿通常是由外伤、肩胛骨炎、先天性发育不良等原因引起。由于疾病是较多的液体在肩胛骨部位积聚，形成的囊性病变，不会伴随着时间的推移而逐渐减小或者自行消失，因此不能够达到自愈目的。若患者不及时采取相应的治疗措施，可能会对肩胛骨部位造成较明显的刺激，诱发局部出现疼痛、活动受限等症状。
患者平时要做好自身的防护措施，根据天气变化及时添减衣物，防止机体受凉。如果病变比较严重，还可以在医生的指导下给予关节进行手术治疗，利用手术能够将病变组织切除。
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